Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDD4

Arap1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arap1Q4LDD4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Arap1Q4LDD4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Arap1Q4LDD4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Arap1Q4LDD4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Arap1Q4LDD4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Arap1Q4LDD4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Arap1Q4LDD4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Arap1Q4LDD4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Arap1Q4LDD4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Arap1Q4LDD4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Arap1Q4LDD4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Arap1Q4LDD4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Arap1Q4LDD4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Arap1Q4LDD4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Arap1Q4LDD4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Arap1Q4LDD4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Arap1Q4LDD4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Arap1Q4LDD4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Arap1Q4LDD4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Arap1Q4LDD4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Arap1Q4LDD4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Arap1Q4LDD4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Arap1Q4LDD4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Arap1Q4LDD4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Arap1Q4LDD4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Arap1Q4LDD4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Arap1Q4LDD4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Arap1Q4LDD4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Arap1Q4LDD4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Arap1Q4LDD4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Arap1Q4LDD4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Arap1Q4LDD4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Arap1Q4LDD4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Arap1Q4LDD4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Arap1Q4LDD4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Arap1Q4LDD4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Arap1Q4LDD4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Arap1Q4LDD4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Arap1Q4LDD4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Arap1Q4LDD4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Arap1Q4LDD4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Arap1Q4LDD4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Arap1Q4LDD4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Arap1Q4LDD4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Arap1Q4LDD4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Arap1Q4LDD4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Arap1Q4LDD4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Arap1Q4LDD4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Arap1Q4LDD4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Arap1Q4LDD4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Arap1Q4LDD4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Arap1Q4LDD4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Arap1Q4LDD4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Arap1Q4LDD4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Arap1Q4LDD4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Arap1Q4LDD4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Arap1Q4LDD4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Arap1Q4LDD4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Arap1Q4LDD4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Arap1Q4LDD4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Arap1Q4LDD4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Arap1Q4LDD4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Arap1Q4LDD4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Arap1Q4LDD4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Arap1Q4LDD4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Arap1Q4LDD4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Arap1Q4LDD4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Arap1Q4LDD4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Arap1Q4LDD4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Arap1Q4LDD4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Arap1Q4LDD4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
Arap1Q4LDD4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Arap1Q4LDD4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Arap1Q4LDD4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Arap1Q4LDD4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms