Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pydc3Q3V3Q4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pydc3Q3V3Q4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pydc3Q3V3Q4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pydc3Q3V3Q4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pydc3Q3V3Q4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pydc3Q3V3Q4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pydc3Q3V3Q4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pydc3Q3V3Q4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pydc3Q3V3Q4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pydc3Q3V3Q4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pydc3Q3V3Q4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pydc3Q3V3Q4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pydc3Q3V3Q4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pydc3Q3V3Q4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pydc3Q3V3Q4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pydc3Q3V3Q4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pydc3Q3V3Q4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pydc3Q3V3Q4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pydc3Q3V3Q4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pydc3Q3V3Q4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pydc3Q3V3Q4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pydc3Q3V3Q4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pydc3Q3V3Q4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pydc3Q3V3Q4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pydc3Q3V3Q4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pydc3Q3V3Q4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pydc3Q3V3Q4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pydc3Q3V3Q4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pydc3Q3V3Q4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pydc3Q3V3Q4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pydc3Q3V3Q4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pydc3Q3V3Q4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pydc3Q3V3Q4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pydc3Q3V3Q4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pydc3Q3V3Q4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pydc3Q3V3Q4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pydc3Q3V3Q4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pydc3Q3V3Q4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pydc3Q3V3Q4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pydc3Q3V3Q4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pydc3Q3V3Q4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pydc3Q3V3Q4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pydc3Q3V3Q4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pydc3Q3V3Q4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pydc3Q3V3Q4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pydc3Q3V3Q4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pydc3Q3V3Q4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pydc3Q3V3Q4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pydc3Q3V3Q4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pydc3Q3V3Q4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pydc3Q3V3Q4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pydc3Q3V3Q4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pydc3Q3V3Q4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pydc3Q3V3Q4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pydc3Q3V3Q4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pydc3Q3V3Q4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pydc3Q3V3Q4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pydc3Q3V3Q4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pydc3Q3V3Q4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pydc3Q3V3Q4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pydc3Q3V3Q4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pydc3Q3V3Q4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pydc3Q3V3Q4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pydc3Q3V3Q4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pydc3Q3V3Q4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pydc3Q3V3Q4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pydc3Q3V3Q4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pydc3Q3V3Q4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pydc3Q3V3Q4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pydc3Q3V3Q4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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