Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc9Q3V038 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc9Q3V038 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc9Q3V038 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc9Q3V038 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc9Q3V038 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc9Q3V038 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc9Q3V038 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc9Q3V038 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc9Q3V038 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc9Q3V038 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc9Q3V038 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc9Q3V038 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc9Q3V038 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc9Q3V038 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc9Q3V038 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc9Q3V038 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc9Q3V038 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc9Q3V038 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc9Q3V038 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc9Q3V038 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc9Q3V038 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc9Q3V038 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc9Q3V038 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc9Q3V038 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc9Q3V038 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc9Q3V038 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc9Q3V038 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc9Q3V038 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc9Q3V038 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc9Q3V038 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc9Q3V038 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc9Q3V038 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc9Q3V038 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc9Q3V038 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc9Q3V038 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc9Q3V038 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc9Q3V038 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc9Q3V038 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc9Q3V038 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc9Q3V038 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc9Q3V038 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc9Q3V038 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc9Q3V038 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc9Q3V038 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc9Q3V038 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc9Q3V038 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc9Q3V038 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc9Q3V038 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc9Q3V038 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc9Q3V038 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc9Q3V038 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc9Q3V038 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc9Q3V038 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc9Q3V038 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc9Q3V038 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc9Q3V038 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc9Q3V038 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc9Q3V038 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc9Q3V038 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc9Q3V038 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc9Q3V038 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc9Q3V038 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc9Q3V038 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc9Q3V038 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc9Q3V038 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc9Q3V038 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc9Q3V038 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc9Q3V038 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc9Q3V038 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc9Q3V038 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc9Q3V038 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc9Q3V038 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc9Q3V038 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc9Q3V038 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc9Q3V038 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc9Q3V038 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc9Q3V038 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc9Q3V038 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc9Q3V038 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc9Q3V038 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc9Q3V038 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc9Q3V038 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc9Q3V038 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc9Q3V038 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc9Q3V038 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc9Q3V038 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc9Q3V038 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc9Q3V038 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc9Q3V038 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc9Q3V038 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc9Q3V038 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc9Q3V038 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc9Q3V038 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc9Q3V038 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc9Q3V038 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc9Q3V038 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc9Q3V038 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc9Q3V038 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc9Q3V038 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms