Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmed1Q3V009 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmed1Q3V009 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmed1Q3V009 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmed1Q3V009 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmed1Q3V009 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmed1Q3V009 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmed1Q3V009 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmed1Q3V009 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmed1Q3V009 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmed1Q3V009 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmed1Q3V009 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmed1Q3V009 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmed1Q3V009 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmed1Q3V009 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmed1Q3V009 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmed1Q3V009 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmed1Q3V009 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmed1Q3V009 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmed1Q3V009 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmed1Q3V009 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmed1Q3V009 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmed1Q3V009 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmed1Q3V009 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmed1Q3V009 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmed1Q3V009 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmed1Q3V009 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmed1Q3V009 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmed1Q3V009 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmed1Q3V009 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmed1Q3V009 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed1Q3V009 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed1Q3V009 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed1Q3V009 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed1Q3V009 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed1Q3V009 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed1Q3V009 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed1Q3V009 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed1Q3V009 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed1Q3V009 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed1Q3V009 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed1Q3V009 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmed1Q3V009 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmed1Q3V009 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmed1Q3V009 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmed1Q3V009 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms