Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3UZV7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UZV7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UZV7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UZV7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UZV7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UZV7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UZV7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3UZV7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UZV7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UZV7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UZV7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UZV7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UZV7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UZV7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UZV7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UZV7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3UZV7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3UZV7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3UZV7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3UZV7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3UZV7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3UZV7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3UZV7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3UZV7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3UZV7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3UZV7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3UZV7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3UZV7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3UZV7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3UZV7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3UZV7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3UZV7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3UZV7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3UZV7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3UZV7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3UZV7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3UZV7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3UZV7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3UZV7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3UZV7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3UZV7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3UZV7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3UZV7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3UZV7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3UZV7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3UZV7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3UZV7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3UZV7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3UZV7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3UZV7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3UZV7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3UZV7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3UZV7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3UZV7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3UZV7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3UZV7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3UZV7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3UZV7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3UZV7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3UZV7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3UZV7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3UZV7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3UZV7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3UZV7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3UZV7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3UZV7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3UZV7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3UZV7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3UZV7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3UZV7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3UZV7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3UZV7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3UZV7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3UZV7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3UZV7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3UZV7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3UZV7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3UZV7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3UZV7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3UZV7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3UZV7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3UZV7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3UZV7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3UZV7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3UZV7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3UZV7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3UZV7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3UZV7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3UZV7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q3UZV7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3UZV7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3UZV7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3UZV7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UZV7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UZV7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UZV7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UZV7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UZV7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UZV7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms