Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZA1

Rcsd1, CapZ-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcsd1Q3UZA1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rcsd1Q3UZA1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rcsd1Q3UZA1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rcsd1Q3UZA1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rcsd1Q3UZA1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rcsd1Q3UZA1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rcsd1Q3UZA1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rcsd1Q3UZA1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rcsd1Q3UZA1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rcsd1Q3UZA1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rcsd1Q3UZA1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rcsd1Q3UZA1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rcsd1Q3UZA1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rcsd1Q3UZA1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rcsd1Q3UZA1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rcsd1Q3UZA1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rcsd1Q3UZA1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rcsd1Q3UZA1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rcsd1Q3UZA1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rcsd1Q3UZA1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rcsd1Q3UZA1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rcsd1Q3UZA1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rcsd1Q3UZA1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rcsd1Q3UZA1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rcsd1Q3UZA1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rcsd1Q3UZA1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rcsd1Q3UZA1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rcsd1Q3UZA1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rcsd1Q3UZA1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rcsd1Q3UZA1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rcsd1Q3UZA1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rcsd1Q3UZA1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rcsd1Q3UZA1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rcsd1Q3UZA1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rcsd1Q3UZA1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rcsd1Q3UZA1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rcsd1Q3UZA1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rcsd1Q3UZA1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rcsd1Q3UZA1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rcsd1Q3UZA1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rcsd1Q3UZA1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rcsd1Q3UZA1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rcsd1Q3UZA1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rcsd1Q3UZA1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rcsd1Q3UZA1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rcsd1Q3UZA1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rcsd1Q3UZA1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rcsd1Q3UZA1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rcsd1Q3UZA1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rcsd1Q3UZA1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rcsd1Q3UZA1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rcsd1Q3UZA1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rcsd1Q3UZA1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rcsd1Q3UZA1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rcsd1Q3UZA1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rcsd1Q3UZA1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rcsd1Q3UZA1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rcsd1Q3UZA1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rcsd1Q3UZA1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rcsd1Q3UZA1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rcsd1Q3UZA1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rcsd1Q3UZA1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rcsd1Q3UZA1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rcsd1Q3UZA1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rcsd1Q3UZA1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rcsd1Q3UZA1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rcsd1Q3UZA1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rcsd1Q3UZA1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rcsd1Q3UZA1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rcsd1Q3UZA1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rcsd1Q3UZA1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rcsd1Q3UZA1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rcsd1Q3UZA1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rcsd1Q3UZA1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rcsd1Q3UZA1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rcsd1Q3UZA1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rcsd1Q3UZA1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rcsd1Q3UZA1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rcsd1Q3UZA1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rcsd1Q3UZA1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rcsd1Q3UZA1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rcsd1Q3UZA1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rcsd1Q3UZA1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rcsd1Q3UZA1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rcsd1Q3UZA1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rcsd1Q3UZA1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rcsd1Q3UZA1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rcsd1Q3UZA1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rcsd1Q3UZA1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rcsd1Q3UZA1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rcsd1Q3UZA1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rcsd1Q3UZA1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rcsd1Q3UZA1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rcsd1Q3UZA1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rcsd1Q3UZA1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rcsd1Q3UZA1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rcsd1Q3UZA1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rcsd1Q3UZA1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rcsd1Q3UZA1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rcsd1Q3UZA1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms