Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc114Q3UX62 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc114Q3UX62 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc114Q3UX62 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc114Q3UX62 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc114Q3UX62 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc114Q3UX62 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc114Q3UX62 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc114Q3UX62 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc114Q3UX62 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc114Q3UX62 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc114Q3UX62 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc114Q3UX62 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc114Q3UX62 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc114Q3UX62 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc114Q3UX62 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc114Q3UX62 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc114Q3UX62 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc114Q3UX62 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc114Q3UX62 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc114Q3UX62 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc114Q3UX62 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc114Q3UX62 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc114Q3UX62 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc114Q3UX62 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc114Q3UX62 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc114Q3UX62 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc114Q3UX62 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc114Q3UX62 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc114Q3UX62 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc114Q3UX62 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc114Q3UX62 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc114Q3UX62 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc114Q3UX62 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc114Q3UX62 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc114Q3UX62 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc114Q3UX62 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc114Q3UX62 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms