Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-Eb2Q3UUV9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-Eb2Q3UUV9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Eb2Q3UUV9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-Eb2Q3UUV9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Eb2Q3UUV9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Eb2Q3UUV9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Eb2Q3UUV9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Eb2Q3UUV9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Eb2Q3UUV9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Eb2Q3UUV9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Eb2Q3UUV9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Eb2Q3UUV9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Eb2Q3UUV9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Eb2Q3UUV9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Eb2Q3UUV9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Eb2Q3UUV9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Eb2Q3UUV9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Eb2Q3UUV9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Eb2Q3UUV9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Eb2Q3UUV9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Eb2Q3UUV9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Eb2Q3UUV9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Eb2Q3UUV9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Eb2Q3UUV9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Eb2Q3UUV9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Eb2Q3UUV9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Eb2Q3UUV9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Eb2Q3UUV9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Eb2Q3UUV9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Eb2Q3UUV9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-Eb2Q3UUV9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-Eb2Q3UUV9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Eb2Q3UUV9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Eb2Q3UUV9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Eb2Q3UUV9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Eb2Q3UUV9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Eb2Q3UUV9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Eb2Q3UUV9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Eb2Q3UUV9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2-Eb2Q3UUV9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-Eb2Q3UUV9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-Eb2Q3UUV9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-Eb2Q3UUV9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Eb2Q3UUV9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Eb2Q3UUV9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Eb2Q3UUV9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Eb2Q3UUV9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Eb2Q3UUV9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Eb2Q3UUV9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Eb2Q3UUV9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Eb2Q3UUV9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Eb2Q3UUV9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Eb2Q3UUV9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Eb2Q3UUV9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Eb2Q3UUV9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Eb2Q3UUV9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Eb2Q3UUV9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Eb2Q3UUV9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Eb2Q3UUV9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Eb2Q3UUV9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Eb2Q3UUV9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Eb2Q3UUV9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Eb2Q3UUV9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Eb2Q3UUV9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Eb2Q3UUV9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Eb2Q3UUV9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms