Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Obox3Q3UT54 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Obox3Q3UT54 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Obox3Q3UT54 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Obox3Q3UT54 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Obox3Q3UT54 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Obox3Q3UT54 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Obox3Q3UT54 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Obox3Q3UT54 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Obox3Q3UT54 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Obox3Q3UT54 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Obox3Q3UT54 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Obox3Q3UT54 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Obox3Q3UT54 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Obox3Q3UT54 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Obox3Q3UT54 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Obox3Q3UT54 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Obox3Q3UT54 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Obox3Q3UT54 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Obox3Q3UT54 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Obox3Q3UT54 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Obox3Q3UT54 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Obox3Q3UT54 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Obox3Q3UT54 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Obox3Q3UT54 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Obox3Q3UT54 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Obox3Q3UT54 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Obox3Q3UT54 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Obox3Q3UT54 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Obox3Q3UT54 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Obox3Q3UT54 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Obox3Q3UT54 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Obox3Q3UT54 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Obox3Q3UT54 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Obox3Q3UT54 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Obox3Q3UT54 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Obox3Q3UT54 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Obox3Q3UT54 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Obox3Q3UT54 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Obox3Q3UT54 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Obox3Q3UT54 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Obox3Q3UT54 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Obox3Q3UT54 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Obox3Q3UT54 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Obox3Q3UT54 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Obox3Q3UT54 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Obox3Q3UT54 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Obox3Q3UT54 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Obox3Q3UT54 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Obox3Q3UT54 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Obox3Q3UT54 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Obox3Q3UT54 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Obox3Q3UT54 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Obox3Q3UT54 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Obox3Q3UT54 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Obox3Q3UT54 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Obox3Q3UT54 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Obox3Q3UT54 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Obox3Q3UT54 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Obox3Q3UT54 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Obox3Q3UT54 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Obox3Q3UT54 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Obox3Q3UT54 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Obox3Q3UT54 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Obox3Q3UT54 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Obox3Q3UT54 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Obox3Q3UT54 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Obox3Q3UT54 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Obox3Q3UT54 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Obox3Q3UT54 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Obox3Q3UT54 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Obox3Q3UT54 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Obox3Q3UT54 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Obox3Q3UT54 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Obox3Q3UT54 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Obox3Q3UT54 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Obox3Q3UT54 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Obox3Q3UT54 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Obox3Q3UT54 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Obox3Q3UT54 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms