Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syndig1lQ3USQ7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syndig1lQ3USQ7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syndig1lQ3USQ7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syndig1lQ3USQ7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syndig1lQ3USQ7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syndig1lQ3USQ7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syndig1lQ3USQ7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syndig1lQ3USQ7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syndig1lQ3USQ7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syndig1lQ3USQ7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syndig1lQ3USQ7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syndig1lQ3USQ7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syndig1lQ3USQ7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syndig1lQ3USQ7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syndig1lQ3USQ7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syndig1lQ3USQ7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syndig1lQ3USQ7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syndig1lQ3USQ7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syndig1lQ3USQ7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syndig1lQ3USQ7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syndig1lQ3USQ7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Syndig1lQ3USQ7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syndig1lQ3USQ7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syndig1lQ3USQ7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syndig1lQ3USQ7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syndig1lQ3USQ7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syndig1lQ3USQ7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syndig1lQ3USQ7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syndig1lQ3USQ7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Syndig1lQ3USQ7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syndig1lQ3USQ7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syndig1lQ3USQ7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syndig1lQ3USQ7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syndig1lQ3USQ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syndig1lQ3USQ7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syndig1lQ3USQ7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syndig1lQ3USQ7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syndig1lQ3USQ7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syndig1lQ3USQ7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syndig1lQ3USQ7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syndig1lQ3USQ7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syndig1lQ3USQ7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syndig1lQ3USQ7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syndig1lQ3USQ7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syndig1lQ3USQ7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syndig1lQ3USQ7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syndig1lQ3USQ7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syndig1lQ3USQ7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syndig1lQ3USQ7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syndig1lQ3USQ7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syndig1lQ3USQ7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syndig1lQ3USQ7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syndig1lQ3USQ7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Syndig1lQ3USQ7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syndig1lQ3USQ7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syndig1lQ3USQ7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syndig1lQ3USQ7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syndig1lQ3USQ7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syndig1lQ3USQ7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syndig1lQ3USQ7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syndig1lQ3USQ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syndig1lQ3USQ7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Syndig1lQ3USQ7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syndig1lQ3USQ7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Syndig1lQ3USQ7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syndig1lQ3USQ7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syndig1lQ3USQ7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syndig1lQ3USQ7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syndig1lQ3USQ7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Syndig1lQ3USQ7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syndig1lQ3USQ7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Syndig1lQ3USQ7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Syndig1lQ3USQ7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syndig1lQ3USQ7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syndig1lQ3USQ7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syndig1lQ3USQ7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syndig1lQ3USQ7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Syndig1lQ3USQ7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syndig1lQ3USQ7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syndig1lQ3USQ7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syndig1lQ3USQ7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syndig1lQ3USQ7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syndig1lQ3USQ7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Syndig1lQ3USQ7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syndig1lQ3USQ7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syndig1lQ3USQ7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syndig1lQ3USQ7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syndig1lQ3USQ7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syndig1lQ3USQ7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syndig1lQ3USQ7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syndig1lQ3USQ7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syndig1lQ3USQ7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syndig1lQ3USQ7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syndig1lQ3USQ7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syndig1lQ3USQ7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syndig1lQ3USQ7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syndig1lQ3USQ7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syndig1lQ3USQ7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Syndig1lQ3USQ7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms