Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm28047Q3US59 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm28047Q3US59 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gm28047Q3US59 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gm28047Q3US59 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gm28047Q3US59 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gm28047Q3US59 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gm28047Q3US59 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm28047Q3US59 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm28047Q3US59 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm28047Q3US59 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm28047Q3US59 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm28047Q3US59 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm28047Q3US59 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm28047Q3US59 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm28047Q3US59 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm28047Q3US59 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm28047Q3US59 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gm28047Q3US59 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gm28047Q3US59 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gm28047Q3US59 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gm28047Q3US59 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gm28047Q3US59 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm28047Q3US59 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm28047Q3US59 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm28047Q3US59 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm28047Q3US59 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm28047Q3US59 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm28047Q3US59 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm28047Q3US59 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm28047Q3US59 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm28047Q3US59 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm28047Q3US59 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm28047Q3US59 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm28047Q3US59 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm28047Q3US59 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm28047Q3US59 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Gm28047Q3US59 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm28047Q3US59 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm28047Q3US59 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm28047Q3US59 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm28047Q3US59 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm28047Q3US59 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm28047Q3US59 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm28047Q3US59 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm28047Q3US59 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm28047Q3US59 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm28047Q3US59 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm28047Q3US59 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm28047Q3US59 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm28047Q3US59 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm28047Q3US59 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm28047Q3US59 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Gm28047Q3US59 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm28047Q3US59 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm28047Q3US59 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm28047Q3US59 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm28047Q3US59 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm28047Q3US59 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm28047Q3US59 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm28047Q3US59 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm28047Q3US59 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm28047Q3US59 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm28047Q3US59 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm28047Q3US59 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm28047Q3US59 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm28047Q3US59 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm28047Q3US59 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm28047Q3US59 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gm28047Q3US59 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm28047Q3US59 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm28047Q3US59 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm28047Q3US59 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm28047Q3US59 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm28047Q3US59 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm28047Q3US59 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm28047Q3US59 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm28047Q3US59 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm28047Q3US59 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm28047Q3US59 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm28047Q3US59 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm28047Q3US59 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm28047Q3US59 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm28047Q3US59 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm28047Q3US59 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gm28047Q3US59 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm28047Q3US59 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm28047Q3US59 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm28047Q3US59 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm28047Q3US59 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm28047Q3US59 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm28047Q3US59 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm28047Q3US59 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm28047Q3US59 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm28047Q3US59 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm28047Q3US59 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm28047Q3US59 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm28047Q3US59 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm28047Q3US59 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm28047Q3US59 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms