Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY4

Gm10549, Predicted gene 10549 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10549Q3URY4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10549Q3URY4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10549Q3URY4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10549Q3URY4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10549Q3URY4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10549Q3URY4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10549Q3URY4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10549Q3URY4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10549Q3URY4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10549Q3URY4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10549Q3URY4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10549Q3URY4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10549Q3URY4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10549Q3URY4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10549Q3URY4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10549Q3URY4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10549Q3URY4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10549Q3URY4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10549Q3URY4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10549Q3URY4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10549Q3URY4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10549Q3URY4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10549Q3URY4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10549Q3URY4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10549Q3URY4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10549Q3URY4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10549Q3URY4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm10549Q3URY4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10549Q3URY4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10549Q3URY4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10549Q3URY4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms