Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Acsf3Q3URE1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acsf3Q3URE1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acsf3Q3URE1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acsf3Q3URE1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acsf3Q3URE1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acsf3Q3URE1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acsf3Q3URE1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acsf3Q3URE1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acsf3Q3URE1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acsf3Q3URE1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acsf3Q3URE1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acsf3Q3URE1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acsf3Q3URE1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acsf3Q3URE1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acsf3Q3URE1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acsf3Q3URE1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acsf3Q3URE1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acsf3Q3URE1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acsf3Q3URE1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acsf3Q3URE1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acsf3Q3URE1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acsf3Q3URE1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acsf3Q3URE1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acsf3Q3URE1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Acsf3Q3URE1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acsf3Q3URE1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acsf3Q3URE1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acsf3Q3URE1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Acsf3Q3URE1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Acsf3Q3URE1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acsf3Q3URE1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acsf3Q3URE1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acsf3Q3URE1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acsf3Q3URE1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acsf3Q3URE1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acsf3Q3URE1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acsf3Q3URE1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Acsf3Q3URE1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acsf3Q3URE1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acsf3Q3URE1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acsf3Q3URE1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Acsf3Q3URE1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Acsf3Q3URE1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acsf3Q3URE1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acsf3Q3URE1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acsf3Q3URE1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acsf3Q3URE1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acsf3Q3URE1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acsf3Q3URE1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acsf3Q3URE1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acsf3Q3URE1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acsf3Q3URE1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acsf3Q3URE1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acsf3Q3URE1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acsf3Q3URE1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acsf3Q3URE1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acsf3Q3URE1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acsf3Q3URE1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acsf3Q3URE1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acsf3Q3URE1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acsf3Q3URE1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acsf3Q3URE1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acsf3Q3URE1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acsf3Q3URE1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acsf3Q3URE1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acsf3Q3URE1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acsf3Q3URE1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acsf3Q3URE1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acsf3Q3URE1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acsf3Q3URE1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acsf3Q3URE1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acsf3Q3URE1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acsf3Q3URE1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acsf3Q3URE1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms