Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Tmem253Q3UNB8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Tmem253Q3UNB8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Tmem253Q3UNB8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Tmem253Q3UNB8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Tmem253Q3UNB8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,23■□□□□ 0,99
Tmem253Q3UNB8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Tmem253Q3UNB8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Tmem253Q3UNB8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21,22■□□□□ 0,99
Tmem253Q3UNB8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Tmem253Q3UNB8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Tmem253Q3UNB8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Tmem253Q3UNB8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,2■□□□□ 0,98
Tmem253Q3UNB8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Tmem253Q3UNB8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Tmem253Q3UNB8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Tmem253Q3UNB8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Tmem253Q3UNB8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Tmem253Q3UNB8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,18■□□□□ 0,98
Tmem253Q3UNB8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Tmem253Q3UNB8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21,18■□□□□ 0,98
Tmem253Q3UNB8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Tmem253Q3UNB8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Tmem253Q3UNB8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21,17■□□□□ 0,98
Tmem253Q3UNB8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,16■□□□□ 0,98
Tmem253Q3UNB8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Tmem253Q3UNB8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Tmem253Q3UNB8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Tmem253Q3UNB8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Tmem253Q3UNB8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
Tmem253Q3UNB8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
Tmem253Q3UNB8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
Tmem253Q3UNB8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
Tmem253Q3UNB8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
Tmem253Q3UNB8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21,14■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21,14■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,12■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21,11■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,1■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21,09■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21,09■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,09■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21,09■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Tmem253Q3UNB8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,08■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,02■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,02■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,02■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21,02■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,02■□□□□ 0,96
Tmem253Q3UNB8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Tmem253Q3UNB8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Tmem253Q3UNB8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Tmem253Q3UNB8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Tmem253Q3UNB8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
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