Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdgfl2Q3UMU9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdgfl2Q3UMU9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdgfl2Q3UMU9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdgfl2Q3UMU9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdgfl2Q3UMU9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdgfl2Q3UMU9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdgfl2Q3UMU9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdgfl2Q3UMU9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hdgfl2Q3UMU9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hdgfl2Q3UMU9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdgfl2Q3UMU9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdgfl2Q3UMU9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdgfl2Q3UMU9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdgfl2Q3UMU9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdgfl2Q3UMU9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdgfl2Q3UMU9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdgfl2Q3UMU9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdgfl2Q3UMU9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdgfl2Q3UMU9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdgfl2Q3UMU9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdgfl2Q3UMU9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdgfl2Q3UMU9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdgfl2Q3UMU9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hdgfl2Q3UMU9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdgfl2Q3UMU9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdgfl2Q3UMU9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdgfl2Q3UMU9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdgfl2Q3UMU9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdgfl2Q3UMU9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdgfl2Q3UMU9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdgfl2Q3UMU9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdgfl2Q3UMU9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdgfl2Q3UMU9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdgfl2Q3UMU9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdgfl2Q3UMU9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdgfl2Q3UMU9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdgfl2Q3UMU9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdgfl2Q3UMU9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdgfl2Q3UMU9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdgfl2Q3UMU9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdgfl2Q3UMU9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdgfl2Q3UMU9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdgfl2Q3UMU9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdgfl2Q3UMU9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdgfl2Q3UMU9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdgfl2Q3UMU9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdgfl2Q3UMU9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdgfl2Q3UMU9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdgfl2Q3UMU9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdgfl2Q3UMU9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdgfl2Q3UMU9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdgfl2Q3UMU9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdgfl2Q3UMU9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdgfl2Q3UMU9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdgfl2Q3UMU9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hdgfl2Q3UMU9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdgfl2Q3UMU9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdgfl2Q3UMU9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdgfl2Q3UMU9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdgfl2Q3UMU9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms