Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMT1

Ppp1r12c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12C, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r12cQ3UMT1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ppp1r12cQ3UMT1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp1r12cQ3UMT1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp1r12cQ3UMT1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp1r12cQ3UMT1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp1r12cQ3UMT1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp1r12cQ3UMT1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp1r12cQ3UMT1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp1r12cQ3UMT1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp1r12cQ3UMT1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp1r12cQ3UMT1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp1r12cQ3UMT1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp1r12cQ3UMT1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp1r12cQ3UMT1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r12cQ3UMT1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r12cQ3UMT1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r12cQ3UMT1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp1r12cQ3UMT1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r12cQ3UMT1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp1r12cQ3UMT1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp1r12cQ3UMT1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r12cQ3UMT1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r12cQ3UMT1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r12cQ3UMT1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp1r12cQ3UMT1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp1r12cQ3UMT1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp1r12cQ3UMT1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp1r12cQ3UMT1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r12cQ3UMT1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r12cQ3UMT1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r12cQ3UMT1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r12cQ3UMT1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r12cQ3UMT1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r12cQ3UMT1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r12cQ3UMT1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r12cQ3UMT1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r12cQ3UMT1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp1r12cQ3UMT1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp1r12cQ3UMT1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp1r12cQ3UMT1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp1r12cQ3UMT1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp1r12cQ3UMT1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r12cQ3UMT1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r12cQ3UMT1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r12cQ3UMT1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r12cQ3UMT1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r12cQ3UMT1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r12cQ3UMT1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r12cQ3UMT1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r12cQ3UMT1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r12cQ3UMT1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r12cQ3UMT1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ppp1r12cQ3UMT1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp1r12cQ3UMT1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp1r12cQ3UMT1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r12cQ3UMT1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r12cQ3UMT1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r12cQ3UMT1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r12cQ3UMT1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r12cQ3UMT1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r12cQ3UMT1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r12cQ3UMT1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp1r12cQ3UMT1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp1r12cQ3UMT1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r12cQ3UMT1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r12cQ3UMT1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r12cQ3UMT1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r12cQ3UMT1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r12cQ3UMT1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r12cQ3UMT1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp1r12cQ3UMT1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp1r12cQ3UMT1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r12cQ3UMT1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r12cQ3UMT1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r12cQ3UMT1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r12cQ3UMT1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r12cQ3UMT1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r12cQ3UMT1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms