Protein–RNA interactions for Protein: Q3UME2

Tmem241, Transmembrane protein 241, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem241Q3UME2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem241Q3UME2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem241Q3UME2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem241Q3UME2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem241Q3UME2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms