Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smu1Q3UKJ7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smu1Q3UKJ7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smu1Q3UKJ7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smu1Q3UKJ7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smu1Q3UKJ7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smu1Q3UKJ7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smu1Q3UKJ7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smu1Q3UKJ7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smu1Q3UKJ7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smu1Q3UKJ7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smu1Q3UKJ7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smu1Q3UKJ7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smu1Q3UKJ7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smu1Q3UKJ7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smu1Q3UKJ7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smu1Q3UKJ7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smu1Q3UKJ7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Smu1Q3UKJ7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smu1Q3UKJ7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Smu1Q3UKJ7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smu1Q3UKJ7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smu1Q3UKJ7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smu1Q3UKJ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smu1Q3UKJ7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smu1Q3UKJ7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smu1Q3UKJ7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smu1Q3UKJ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smu1Q3UKJ7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smu1Q3UKJ7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smu1Q3UKJ7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smu1Q3UKJ7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smu1Q3UKJ7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smu1Q3UKJ7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Smu1Q3UKJ7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smu1Q3UKJ7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smu1Q3UKJ7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smu1Q3UKJ7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smu1Q3UKJ7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smu1Q3UKJ7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smu1Q3UKJ7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smu1Q3UKJ7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smu1Q3UKJ7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smu1Q3UKJ7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smu1Q3UKJ7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smu1Q3UKJ7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smu1Q3UKJ7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smu1Q3UKJ7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smu1Q3UKJ7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smu1Q3UKJ7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smu1Q3UKJ7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smu1Q3UKJ7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Smu1Q3UKJ7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smu1Q3UKJ7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smu1Q3UKJ7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smu1Q3UKJ7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smu1Q3UKJ7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smu1Q3UKJ7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smu1Q3UKJ7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smu1Q3UKJ7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smu1Q3UKJ7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smu1Q3UKJ7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smu1Q3UKJ7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smu1Q3UKJ7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smu1Q3UKJ7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smu1Q3UKJ7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smu1Q3UKJ7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smu1Q3UKJ7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smu1Q3UKJ7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smu1Q3UKJ7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smu1Q3UKJ7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smu1Q3UKJ7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smu1Q3UKJ7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smu1Q3UKJ7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smu1Q3UKJ7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smu1Q3UKJ7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smu1Q3UKJ7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smu1Q3UKJ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smu1Q3UKJ7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smu1Q3UKJ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smu1Q3UKJ7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smu1Q3UKJ7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smu1Q3UKJ7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smu1Q3UKJ7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smu1Q3UKJ7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smu1Q3UKJ7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smu1Q3UKJ7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smu1Q3UKJ7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smu1Q3UKJ7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smu1Q3UKJ7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smu1Q3UKJ7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smu1Q3UKJ7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smu1Q3UKJ7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smu1Q3UKJ7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smu1Q3UKJ7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smu1Q3UKJ7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smu1Q3UKJ7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smu1Q3UKJ7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smu1Q3UKJ7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smu1Q3UKJ7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms