Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJK4

Gtpbp2, GTP-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp2Q3UJK4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtpbp2Q3UJK4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtpbp2Q3UJK4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtpbp2Q3UJK4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtpbp2Q3UJK4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtpbp2Q3UJK4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtpbp2Q3UJK4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtpbp2Q3UJK4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtpbp2Q3UJK4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtpbp2Q3UJK4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtpbp2Q3UJK4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp2Q3UJK4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp2Q3UJK4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp2Q3UJK4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp2Q3UJK4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp2Q3UJK4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtpbp2Q3UJK4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtpbp2Q3UJK4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtpbp2Q3UJK4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp2Q3UJK4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp2Q3UJK4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp2Q3UJK4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp2Q3UJK4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtpbp2Q3UJK4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtpbp2Q3UJK4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtpbp2Q3UJK4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtpbp2Q3UJK4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtpbp2Q3UJK4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtpbp2Q3UJK4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtpbp2Q3UJK4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp2Q3UJK4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp2Q3UJK4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp2Q3UJK4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp2Q3UJK4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp2Q3UJK4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp2Q3UJK4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtpbp2Q3UJK4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtpbp2Q3UJK4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtpbp2Q3UJK4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtpbp2Q3UJK4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtpbp2Q3UJK4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtpbp2Q3UJK4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp2Q3UJK4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp2Q3UJK4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp2Q3UJK4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp2Q3UJK4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtpbp2Q3UJK4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtpbp2Q3UJK4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtpbp2Q3UJK4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtpbp2Q3UJK4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtpbp2Q3UJK4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp2Q3UJK4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp2Q3UJK4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp2Q3UJK4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp2Q3UJK4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp2Q3UJK4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp2Q3UJK4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp2Q3UJK4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp2Q3UJK4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Gtpbp2Q3UJK4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtpbp2Q3UJK4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtpbp2Q3UJK4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtpbp2Q3UJK4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtpbp2Q3UJK4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtpbp2Q3UJK4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtpbp2Q3UJK4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gtpbp2Q3UJK4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtpbp2Q3UJK4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtpbp2Q3UJK4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtpbp2Q3UJK4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtpbp2Q3UJK4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtpbp2Q3UJK4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtpbp2Q3UJK4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtpbp2Q3UJK4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtpbp2Q3UJK4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtpbp2Q3UJK4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtpbp2Q3UJK4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtpbp2Q3UJK4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtpbp2Q3UJK4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtpbp2Q3UJK4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtpbp2Q3UJK4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtpbp2Q3UJK4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtpbp2Q3UJK4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtpbp2Q3UJK4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtpbp2Q3UJK4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtpbp2Q3UJK4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtpbp2Q3UJK4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtpbp2Q3UJK4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtpbp2Q3UJK4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtpbp2Q3UJK4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtpbp2Q3UJK4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtpbp2Q3UJK4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtpbp2Q3UJK4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtpbp2Q3UJK4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtpbp2Q3UJK4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp2Q3UJK4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp2Q3UJK4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtpbp2Q3UJK4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtpbp2Q3UJK4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtpbp2Q3UJK4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms