Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHU5

Mtcl1, Microtubule cross-linking factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtcl1Q3UHU5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Mtcl1Q3UHU5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Mtcl1Q3UHU5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mtcl1Q3UHU5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mtcl1Q3UHU5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mtcl1Q3UHU5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mtcl1Q3UHU5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mtcl1Q3UHU5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mtcl1Q3UHU5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mtcl1Q3UHU5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mtcl1Q3UHU5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mtcl1Q3UHU5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mtcl1Q3UHU5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Mtcl1Q3UHU5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mtcl1Q3UHU5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mtcl1Q3UHU5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mtcl1Q3UHU5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mtcl1Q3UHU5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mtcl1Q3UHU5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mtcl1Q3UHU5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mtcl1Q3UHU5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mtcl1Q3UHU5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mtcl1Q3UHU5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Mtcl1Q3UHU5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mtcl1Q3UHU5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mtcl1Q3UHU5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mtcl1Q3UHU5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Mtcl1Q3UHU5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mtcl1Q3UHU5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Mtcl1Q3UHU5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mtcl1Q3UHU5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Mtcl1Q3UHU5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mtcl1Q3UHU5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mtcl1Q3UHU5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mtcl1Q3UHU5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mtcl1Q3UHU5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mtcl1Q3UHU5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Mtcl1Q3UHU5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Mtcl1Q3UHU5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Mtcl1Q3UHU5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Mtcl1Q3UHU5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Mtcl1Q3UHU5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mtcl1Q3UHU5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mtcl1Q3UHU5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mtcl1Q3UHU5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mtcl1Q3UHU5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mtcl1Q3UHU5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Mtcl1Q3UHU5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mtcl1Q3UHU5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Mtcl1Q3UHU5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mtcl1Q3UHU5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mtcl1Q3UHU5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Mtcl1Q3UHU5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Mtcl1Q3UHU5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Mtcl1Q3UHU5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mtcl1Q3UHU5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mtcl1Q3UHU5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mtcl1Q3UHU5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Mtcl1Q3UHU5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mtcl1Q3UHU5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mtcl1Q3UHU5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mtcl1Q3UHU5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Mtcl1Q3UHU5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mtcl1Q3UHU5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mtcl1Q3UHU5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mtcl1Q3UHU5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mtcl1Q3UHU5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Mtcl1Q3UHU5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Mtcl1Q3UHU5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mtcl1Q3UHU5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mtcl1Q3UHU5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mtcl1Q3UHU5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mtcl1Q3UHU5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mtcl1Q3UHU5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mtcl1Q3UHU5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mtcl1Q3UHU5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mtcl1Q3UHU5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mtcl1Q3UHU5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mtcl1Q3UHU5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mtcl1Q3UHU5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mtcl1Q3UHU5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mtcl1Q3UHU5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mtcl1Q3UHU5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mtcl1Q3UHU5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mtcl1Q3UHU5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mtcl1Q3UHU5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mtcl1Q3UHU5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mtcl1Q3UHU5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mtcl1Q3UHU5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Mtcl1Q3UHU5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mtcl1Q3UHU5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mtcl1Q3UHU5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Mtcl1Q3UHU5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mtcl1Q3UHU5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mtcl1Q3UHU5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mtcl1Q3UHU5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mtcl1Q3UHU5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mtcl1Q3UHU5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mtcl1Q3UHU5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Mtcl1Q3UHU5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms