Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tmed8Q3UHI4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tmed8Q3UHI4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmed8Q3UHI4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmed8Q3UHI4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmed8Q3UHI4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmed8Q3UHI4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmed8Q3UHI4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmed8Q3UHI4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmed8Q3UHI4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmed8Q3UHI4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tmed8Q3UHI4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tmed8Q3UHI4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tmed8Q3UHI4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmed8Q3UHI4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmed8Q3UHI4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmed8Q3UHI4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmed8Q3UHI4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmed8Q3UHI4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmed8Q3UHI4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmed8Q3UHI4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmed8Q3UHI4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmed8Q3UHI4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmed8Q3UHI4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmed8Q3UHI4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmed8Q3UHI4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmed8Q3UHI4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmed8Q3UHI4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmed8Q3UHI4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmed8Q3UHI4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmed8Q3UHI4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmed8Q3UHI4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmed8Q3UHI4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmed8Q3UHI4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmed8Q3UHI4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmed8Q3UHI4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmed8Q3UHI4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmed8Q3UHI4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tmed8Q3UHI4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tmed8Q3UHI4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tmed8Q3UHI4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tmed8Q3UHI4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmed8Q3UHI4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmed8Q3UHI4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmed8Q3UHI4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmed8Q3UHI4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmed8Q3UHI4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmed8Q3UHI4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmed8Q3UHI4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tmed8Q3UHI4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tmed8Q3UHI4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Tmed8Q3UHI4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmed8Q3UHI4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmed8Q3UHI4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmed8Q3UHI4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmed8Q3UHI4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmed8Q3UHI4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmed8Q3UHI4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmed8Q3UHI4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmed8Q3UHI4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmed8Q3UHI4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmed8Q3UHI4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmed8Q3UHI4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmed8Q3UHI4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmed8Q3UHI4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmed8Q3UHI4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmed8Q3UHI4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmed8Q3UHI4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmed8Q3UHI4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmed8Q3UHI4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmed8Q3UHI4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmed8Q3UHI4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmed8Q3UHI4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmed8Q3UHI4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmed8Q3UHI4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmed8Q3UHI4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmed8Q3UHI4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmed8Q3UHI4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmed8Q3UHI4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmed8Q3UHI4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmed8Q3UHI4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmed8Q3UHI4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmed8Q3UHI4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmed8Q3UHI4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tmed8Q3UHI4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Tmed8Q3UHI4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmed8Q3UHI4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmed8Q3UHI4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmed8Q3UHI4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmed8Q3UHI4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Tmed8Q3UHI4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Tmed8Q3UHI4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Tmed8Q3UHI4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tmed8Q3UHI4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tmed8Q3UHI4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tmed8Q3UHI4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tmed8Q3UHI4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tmed8Q3UHI4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tmed8Q3UHI4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tmed8Q3UHI4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms