Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH2

Slc22a23, Solute carrier family 22 member 23, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a23Q3UHH2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc22a23Q3UHH2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc22a23Q3UHH2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc22a23Q3UHH2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc22a23Q3UHH2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc22a23Q3UHH2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc22a23Q3UHH2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc22a23Q3UHH2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc22a23Q3UHH2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc22a23Q3UHH2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc22a23Q3UHH2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc22a23Q3UHH2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc22a23Q3UHH2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc22a23Q3UHH2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc22a23Q3UHH2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc22a23Q3UHH2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc22a23Q3UHH2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc22a23Q3UHH2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc22a23Q3UHH2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc22a23Q3UHH2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc22a23Q3UHH2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc22a23Q3UHH2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc22a23Q3UHH2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc22a23Q3UHH2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc22a23Q3UHH2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc22a23Q3UHH2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc22a23Q3UHH2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc22a23Q3UHH2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc22a23Q3UHH2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc22a23Q3UHH2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc22a23Q3UHH2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc22a23Q3UHH2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc22a23Q3UHH2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc22a23Q3UHH2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc22a23Q3UHH2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc22a23Q3UHH2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc22a23Q3UHH2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc22a23Q3UHH2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc22a23Q3UHH2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc22a23Q3UHH2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Slc22a23Q3UHH2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc22a23Q3UHH2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc22a23Q3UHH2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc22a23Q3UHH2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms