Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttll12Q3UDE2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttll12Q3UDE2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttll12Q3UDE2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttll12Q3UDE2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttll12Q3UDE2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ttll12Q3UDE2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ttll12Q3UDE2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ttll12Q3UDE2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttll12Q3UDE2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttll12Q3UDE2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ttll12Q3UDE2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ttll12Q3UDE2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ttll12Q3UDE2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ttll12Q3UDE2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ttll12Q3UDE2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ttll12Q3UDE2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ttll12Q3UDE2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ttll12Q3UDE2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ttll12Q3UDE2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ttll12Q3UDE2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ttll12Q3UDE2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ttll12Q3UDE2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ttll12Q3UDE2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ttll12Q3UDE2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ttll12Q3UDE2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ttll12Q3UDE2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ttll12Q3UDE2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ttll12Q3UDE2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ttll12Q3UDE2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ttll12Q3UDE2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ttll12Q3UDE2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ttll12Q3UDE2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ttll12Q3UDE2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ttll12Q3UDE2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ttll12Q3UDE2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ttll12Q3UDE2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ttll12Q3UDE2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ttll12Q3UDE2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ttll12Q3UDE2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ttll12Q3UDE2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ttll12Q3UDE2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ttll12Q3UDE2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ttll12Q3UDE2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ttll12Q3UDE2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ttll12Q3UDE2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ttll12Q3UDE2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ttll12Q3UDE2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ttll12Q3UDE2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ttll12Q3UDE2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ttll12Q3UDE2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ttll12Q3UDE2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ttll12Q3UDE2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ttll12Q3UDE2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ttll12Q3UDE2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ttll12Q3UDE2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ttll12Q3UDE2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ttll12Q3UDE2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ttll12Q3UDE2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ttll12Q3UDE2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ttll12Q3UDE2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ttll12Q3UDE2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ttll12Q3UDE2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ttll12Q3UDE2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ttll12Q3UDE2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ttll12Q3UDE2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ttll12Q3UDE2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ttll12Q3UDE2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ttll12Q3UDE2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ttll12Q3UDE2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ttll12Q3UDE2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ttll12Q3UDE2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ttll12Q3UDE2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ttll12Q3UDE2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ttll12Q3UDE2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ttll12Q3UDE2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ttll12Q3UDE2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ttll12Q3UDE2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ttll12Q3UDE2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ttll12Q3UDE2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ttll12Q3UDE2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ttll12Q3UDE2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ttll12Q3UDE2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ttll12Q3UDE2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ttll12Q3UDE2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ttll12Q3UDE2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ttll12Q3UDE2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ttll12Q3UDE2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ttll12Q3UDE2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ttll12Q3UDE2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ttll12Q3UDE2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ttll12Q3UDE2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ttll12Q3UDE2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttll12Q3UDE2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttll12Q3UDE2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttll12Q3UDE2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttll12Q3UDE2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ttll12Q3UDE2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ttll12Q3UDE2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ttll12Q3UDE2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms