Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brf2Q3UAW9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brf2Q3UAW9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brf2Q3UAW9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Brf2Q3UAW9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brf2Q3UAW9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brf2Q3UAW9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brf2Q3UAW9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brf2Q3UAW9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brf2Q3UAW9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brf2Q3UAW9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brf2Q3UAW9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brf2Q3UAW9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brf2Q3UAW9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brf2Q3UAW9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brf2Q3UAW9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brf2Q3UAW9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brf2Q3UAW9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brf2Q3UAW9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brf2Q3UAW9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brf2Q3UAW9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brf2Q3UAW9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brf2Q3UAW9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brf2Q3UAW9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brf2Q3UAW9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brf2Q3UAW9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Brf2Q3UAW9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Brf2Q3UAW9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brf2Q3UAW9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brf2Q3UAW9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brf2Q3UAW9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brf2Q3UAW9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brf2Q3UAW9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brf2Q3UAW9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brf2Q3UAW9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brf2Q3UAW9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brf2Q3UAW9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brf2Q3UAW9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Brf2Q3UAW9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Brf2Q3UAW9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brf2Q3UAW9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brf2Q3UAW9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brf2Q3UAW9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brf2Q3UAW9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brf2Q3UAW9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Brf2Q3UAW9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Brf2Q3UAW9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brf2Q3UAW9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brf2Q3UAW9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brf2Q3UAW9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brf2Q3UAW9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brf2Q3UAW9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brf2Q3UAW9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brf2Q3UAW9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Brf2Q3UAW9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf2Q3UAW9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf2Q3UAW9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf2Q3UAW9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brf2Q3UAW9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brf2Q3UAW9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brf2Q3UAW9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brf2Q3UAW9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Brf2Q3UAW9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brf2Q3UAW9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brf2Q3UAW9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brf2Q3UAW9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brf2Q3UAW9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brf2Q3UAW9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brf2Q3UAW9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brf2Q3UAW9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brf2Q3UAW9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brf2Q3UAW9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brf2Q3UAW9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms