Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3S3

Cenpl, Centromere protein L, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenplQ3U3S3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CenplQ3U3S3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CenplQ3U3S3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CenplQ3U3S3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CenplQ3U3S3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CenplQ3U3S3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CenplQ3U3S3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CenplQ3U3S3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CenplQ3U3S3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CenplQ3U3S3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CenplQ3U3S3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CenplQ3U3S3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CenplQ3U3S3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CenplQ3U3S3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CenplQ3U3S3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CenplQ3U3S3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CenplQ3U3S3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CenplQ3U3S3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CenplQ3U3S3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CenplQ3U3S3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CenplQ3U3S3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CenplQ3U3S3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CenplQ3U3S3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CenplQ3U3S3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CenplQ3U3S3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CenplQ3U3S3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CenplQ3U3S3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CenplQ3U3S3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CenplQ3U3S3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CenplQ3U3S3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CenplQ3U3S3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CenplQ3U3S3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CenplQ3U3S3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CenplQ3U3S3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CenplQ3U3S3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenplQ3U3S3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenplQ3U3S3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenplQ3U3S3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenplQ3U3S3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenplQ3U3S3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CenplQ3U3S3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CenplQ3U3S3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenplQ3U3S3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenplQ3U3S3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CenplQ3U3S3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CenplQ3U3S3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CenplQ3U3S3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CenplQ3U3S3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CenplQ3U3S3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenplQ3U3S3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenplQ3U3S3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenplQ3U3S3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenplQ3U3S3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CenplQ3U3S3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenplQ3U3S3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenplQ3U3S3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenplQ3U3S3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenplQ3U3S3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenplQ3U3S3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenplQ3U3S3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenplQ3U3S3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenplQ3U3S3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenplQ3U3S3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenplQ3U3S3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenplQ3U3S3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenplQ3U3S3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenplQ3U3S3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenplQ3U3S3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenplQ3U3S3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenplQ3U3S3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CenplQ3U3S3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenplQ3U3S3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenplQ3U3S3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenplQ3U3S3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenplQ3U3S3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenplQ3U3S3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenplQ3U3S3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenplQ3U3S3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenplQ3U3S3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenplQ3U3S3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CenplQ3U3S3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CenplQ3U3S3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenplQ3U3S3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenplQ3U3S3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenplQ3U3S3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CenplQ3U3S3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CenplQ3U3S3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenplQ3U3S3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenplQ3U3S3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenplQ3U3S3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenplQ3U3S3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenplQ3U3S3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenplQ3U3S3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenplQ3U3S3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenplQ3U3S3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenplQ3U3S3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenplQ3U3S3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenplQ3U3S3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenplQ3U3S3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenplQ3U3S3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms