Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pag1Q3U1F9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pag1Q3U1F9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pag1Q3U1F9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pag1Q3U1F9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pag1Q3U1F9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pag1Q3U1F9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pag1Q3U1F9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pag1Q3U1F9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pag1Q3U1F9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pag1Q3U1F9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pag1Q3U1F9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pag1Q3U1F9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pag1Q3U1F9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pag1Q3U1F9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pag1Q3U1F9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pag1Q3U1F9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pag1Q3U1F9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pag1Q3U1F9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pag1Q3U1F9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pag1Q3U1F9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pag1Q3U1F9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pag1Q3U1F9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pag1Q3U1F9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pag1Q3U1F9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pag1Q3U1F9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pag1Q3U1F9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pag1Q3U1F9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pag1Q3U1F9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pag1Q3U1F9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pag1Q3U1F9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pag1Q3U1F9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pag1Q3U1F9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pag1Q3U1F9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pag1Q3U1F9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pag1Q3U1F9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pag1Q3U1F9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pag1Q3U1F9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pag1Q3U1F9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pag1Q3U1F9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pag1Q3U1F9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pag1Q3U1F9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pag1Q3U1F9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pag1Q3U1F9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pag1Q3U1F9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pag1Q3U1F9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pag1Q3U1F9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pag1Q3U1F9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pag1Q3U1F9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pag1Q3U1F9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pag1Q3U1F9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pag1Q3U1F9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pag1Q3U1F9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pag1Q3U1F9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pag1Q3U1F9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pag1Q3U1F9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pag1Q3U1F9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pag1Q3U1F9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pag1Q3U1F9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pag1Q3U1F9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pag1Q3U1F9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pag1Q3U1F9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pag1Q3U1F9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pag1Q3U1F9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pag1Q3U1F9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pag1Q3U1F9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pag1Q3U1F9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pag1Q3U1F9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pag1Q3U1F9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pag1Q3U1F9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pag1Q3U1F9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pag1Q3U1F9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pag1Q3U1F9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pag1Q3U1F9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pag1Q3U1F9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms