Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc9Q3U0M1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc9Q3U0M1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc9Q3U0M1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc9Q3U0M1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc9Q3U0M1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc9Q3U0M1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc9Q3U0M1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc9Q3U0M1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc9Q3U0M1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc9Q3U0M1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trappc9Q3U0M1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trappc9Q3U0M1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc9Q3U0M1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc9Q3U0M1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc9Q3U0M1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc9Q3U0M1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc9Q3U0M1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc9Q3U0M1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc9Q3U0M1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc9Q3U0M1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc9Q3U0M1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc9Q3U0M1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc9Q3U0M1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc9Q3U0M1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc9Q3U0M1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc9Q3U0M1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc9Q3U0M1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc9Q3U0M1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc9Q3U0M1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc9Q3U0M1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc9Q3U0M1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc9Q3U0M1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc9Q3U0M1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc9Q3U0M1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc9Q3U0M1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc9Q3U0M1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc9Q3U0M1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc9Q3U0M1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc9Q3U0M1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc9Q3U0M1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc9Q3U0M1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc9Q3U0M1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc9Q3U0M1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc9Q3U0M1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc9Q3U0M1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc9Q3U0M1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc9Q3U0M1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc9Q3U0M1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc9Q3U0M1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc9Q3U0M1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc9Q3U0M1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc9Q3U0M1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc9Q3U0M1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc9Q3U0M1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc9Q3U0M1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc9Q3U0M1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc9Q3U0M1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc9Q3U0M1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc9Q3U0M1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc9Q3U0M1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc9Q3U0M1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc9Q3U0M1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc9Q3U0M1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc9Q3U0M1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc9Q3U0M1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc9Q3U0M1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc9Q3U0M1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc9Q3U0M1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc9Q3U0M1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc9Q3U0M1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc9Q3U0M1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc9Q3U0M1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc9Q3U0M1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc9Q3U0M1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc9Q3U0M1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc9Q3U0M1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc9Q3U0M1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc9Q3U0M1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc9Q3U0M1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc9Q3U0M1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trappc9Q3U0M1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trappc9Q3U0M1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trappc9Q3U0M1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trappc9Q3U0M1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trappc9Q3U0M1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trappc9Q3U0M1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trappc9Q3U0M1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc9Q3U0M1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc9Q3U0M1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc9Q3U0M1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc9Q3U0M1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trappc9Q3U0M1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trappc9Q3U0M1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc9Q3U0M1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc9Q3U0M1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trappc9Q3U0M1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc9Q3U0M1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc9Q3U0M1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc9Q3U0M1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms