Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc17a7Q3TXX4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc17a7Q3TXX4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc17a7Q3TXX4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc17a7Q3TXX4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc17a7Q3TXX4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc17a7Q3TXX4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc17a7Q3TXX4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc17a7Q3TXX4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc17a7Q3TXX4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc17a7Q3TXX4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc17a7Q3TXX4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc17a7Q3TXX4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc17a7Q3TXX4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc17a7Q3TXX4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc17a7Q3TXX4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc17a7Q3TXX4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc17a7Q3TXX4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc17a7Q3TXX4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc17a7Q3TXX4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc17a7Q3TXX4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc17a7Q3TXX4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc17a7Q3TXX4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc17a7Q3TXX4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc17a7Q3TXX4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc17a7Q3TXX4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc17a7Q3TXX4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc17a7Q3TXX4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc17a7Q3TXX4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc17a7Q3TXX4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc17a7Q3TXX4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc17a7Q3TXX4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc17a7Q3TXX4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc17a7Q3TXX4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc17a7Q3TXX4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc17a7Q3TXX4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc17a7Q3TXX4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc17a7Q3TXX4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc17a7Q3TXX4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc17a7Q3TXX4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc17a7Q3TXX4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc17a7Q3TXX4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc17a7Q3TXX4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc17a7Q3TXX4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc17a7Q3TXX4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc17a7Q3TXX4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc17a7Q3TXX4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc17a7Q3TXX4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc17a7Q3TXX4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc17a7Q3TXX4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc17a7Q3TXX4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc17a7Q3TXX4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc17a7Q3TXX4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc17a7Q3TXX4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc17a7Q3TXX4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc17a7Q3TXX4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc17a7Q3TXX4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc17a7Q3TXX4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc17a7Q3TXX4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc17a7Q3TXX4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc17a7Q3TXX4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc17a7Q3TXX4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc17a7Q3TXX4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc17a7Q3TXX4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc17a7Q3TXX4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc17a7Q3TXX4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc17a7Q3TXX4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc17a7Q3TXX4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc17a7Q3TXX4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc17a7Q3TXX4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc17a7Q3TXX4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms