Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Treml4Q3LRV9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Treml4Q3LRV9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Treml4Q3LRV9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Treml4Q3LRV9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Treml4Q3LRV9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Treml4Q3LRV9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Treml4Q3LRV9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Treml4Q3LRV9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Treml4Q3LRV9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Treml4Q3LRV9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Treml4Q3LRV9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Treml4Q3LRV9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Treml4Q3LRV9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Treml4Q3LRV9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Treml4Q3LRV9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Treml4Q3LRV9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Treml4Q3LRV9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Treml4Q3LRV9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Treml4Q3LRV9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Treml4Q3LRV9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Treml4Q3LRV9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Treml4Q3LRV9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Treml4Q3LRV9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Treml4Q3LRV9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Treml4Q3LRV9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Treml4Q3LRV9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Treml4Q3LRV9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Treml4Q3LRV9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Treml4Q3LRV9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Treml4Q3LRV9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Treml4Q3LRV9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Treml4Q3LRV9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Treml4Q3LRV9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Treml4Q3LRV9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Treml4Q3LRV9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Treml4Q3LRV9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Treml4Q3LRV9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Treml4Q3LRV9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Treml4Q3LRV9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Treml4Q3LRV9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Treml4Q3LRV9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Treml4Q3LRV9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Treml4Q3LRV9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Treml4Q3LRV9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Treml4Q3LRV9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Treml4Q3LRV9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Treml4Q3LRV9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Treml4Q3LRV9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Treml4Q3LRV9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Treml4Q3LRV9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Treml4Q3LRV9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 327.2 ms