Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rtl9Q32KG4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl9Q32KG4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl9Q32KG4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rtl9Q32KG4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rtl9Q32KG4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rtl9Q32KG4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtl9Q32KG4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtl9Q32KG4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtl9Q32KG4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtl9Q32KG4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtl9Q32KG4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rtl9Q32KG4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rtl9Q32KG4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rtl9Q32KG4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rtl9Q32KG4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rtl9Q32KG4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rtl9Q32KG4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rtl9Q32KG4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rtl9Q32KG4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rtl9Q32KG4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl9Q32KG4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl9Q32KG4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl9Q32KG4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl9Q32KG4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rtl9Q32KG4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtl9Q32KG4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtl9Q32KG4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl9Q32KG4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl9Q32KG4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl9Q32KG4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtl9Q32KG4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtl9Q32KG4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtl9Q32KG4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtl9Q32KG4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtl9Q32KG4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtl9Q32KG4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtl9Q32KG4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rtl9Q32KG4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rtl9Q32KG4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtl9Q32KG4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtl9Q32KG4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtl9Q32KG4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtl9Q32KG4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtl9Q32KG4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtl9Q32KG4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtl9Q32KG4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtl9Q32KG4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtl9Q32KG4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtl9Q32KG4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtl9Q32KG4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtl9Q32KG4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtl9Q32KG4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtl9Q32KG4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtl9Q32KG4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtl9Q32KG4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtl9Q32KG4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtl9Q32KG4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtl9Q32KG4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtl9Q32KG4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtl9Q32KG4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtl9Q32KG4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtl9Q32KG4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtl9Q32KG4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtl9Q32KG4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtl9Q32KG4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtl9Q32KG4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtl9Q32KG4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtl9Q32KG4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtl9Q32KG4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtl9Q32KG4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtl9Q32KG4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rtl9Q32KG4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rtl9Q32KG4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rtl9Q32KG4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rtl9Q32KG4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtl9Q32KG4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtl9Q32KG4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtl9Q32KG4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtl9Q32KG4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtl9Q32KG4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtl9Q32KG4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtl9Q32KG4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtl9Q32KG4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtl9Q32KG4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl9Q32KG4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl9Q32KG4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtl9Q32KG4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtl9Q32KG4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtl9Q32KG4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtl9Q32KG4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rtl9Q32KG4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtl9Q32KG4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtl9Q32KG4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtl9Q32KG4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtl9Q32KG4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtl9Q32KG4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtl9Q32KG4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtl9Q32KG4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtl9Q32KG4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms