Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG0

Rhox4d, Reproductive homeobox 4D, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4dQ2MDG0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox4dQ2MDG0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox4dQ2MDG0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox4dQ2MDG0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox4dQ2MDG0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox4dQ2MDG0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox4dQ2MDG0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox4dQ2MDG0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox4dQ2MDG0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rhox4dQ2MDG0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox4dQ2MDG0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms