Protein–RNA interactions for Protein: Q2HXL6

Edem3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem3Q2HXL6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Edem3Q2HXL6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Edem3Q2HXL6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Edem3Q2HXL6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Edem3Q2HXL6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Edem3Q2HXL6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Edem3Q2HXL6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Edem3Q2HXL6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Edem3Q2HXL6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Edem3Q2HXL6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Edem3Q2HXL6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Edem3Q2HXL6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Edem3Q2HXL6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Edem3Q2HXL6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Edem3Q2HXL6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Edem3Q2HXL6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Edem3Q2HXL6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Edem3Q2HXL6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Edem3Q2HXL6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Edem3Q2HXL6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Edem3Q2HXL6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Edem3Q2HXL6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Edem3Q2HXL6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Edem3Q2HXL6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Edem3Q2HXL6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Edem3Q2HXL6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Edem3Q2HXL6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Edem3Q2HXL6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Edem3Q2HXL6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Edem3Q2HXL6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Edem3Q2HXL6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Edem3Q2HXL6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Edem3Q2HXL6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Edem3Q2HXL6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Edem3Q2HXL6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Edem3Q2HXL6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Edem3Q2HXL6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Edem3Q2HXL6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Edem3Q2HXL6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Edem3Q2HXL6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Edem3Q2HXL6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Edem3Q2HXL6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Edem3Q2HXL6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Edem3Q2HXL6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Edem3Q2HXL6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Edem3Q2HXL6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Edem3Q2HXL6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Edem3Q2HXL6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Edem3Q2HXL6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Edem3Q2HXL6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Edem3Q2HXL6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Edem3Q2HXL6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Edem3Q2HXL6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Edem3Q2HXL6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Edem3Q2HXL6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Edem3Q2HXL6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Edem3Q2HXL6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Edem3Q2HXL6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Edem3Q2HXL6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Edem3Q2HXL6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Edem3Q2HXL6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Edem3Q2HXL6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Edem3Q2HXL6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Edem3Q2HXL6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Edem3Q2HXL6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Edem3Q2HXL6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Edem3Q2HXL6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Edem3Q2HXL6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Edem3Q2HXL6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Edem3Q2HXL6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Edem3Q2HXL6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Edem3Q2HXL6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Edem3Q2HXL6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Edem3Q2HXL6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Edem3Q2HXL6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Edem3Q2HXL6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Edem3Q2HXL6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Edem3Q2HXL6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Edem3Q2HXL6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Edem3Q2HXL6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Edem3Q2HXL6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Edem3Q2HXL6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Edem3Q2HXL6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Edem3Q2HXL6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Edem3Q2HXL6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Edem3Q2HXL6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Edem3Q2HXL6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Edem3Q2HXL6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Edem3Q2HXL6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Edem3Q2HXL6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Edem3Q2HXL6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Edem3Q2HXL6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Edem3Q2HXL6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Edem3Q2HXL6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Edem3Q2HXL6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Edem3Q2HXL6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Edem3Q2HXL6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Edem3Q2HXL6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Edem3Q2HXL6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Edem3Q2HXL6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms