Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Shroom4Q1W617 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
Shroom4Q1W617 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
Shroom4Q1W617 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Shroom4Q1W617 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Shroom4Q1W617 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Shroom4Q1W617 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Shroom4Q1W617 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Shroom4Q1W617 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
Shroom4Q1W617 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Shroom4Q1W617 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Shroom4Q1W617 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Shroom4Q1W617 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
Shroom4Q1W617 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Shroom4Q1W617 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Shroom4Q1W617 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
Shroom4Q1W617 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Shroom4Q1W617 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Shroom4Q1W617 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Shroom4Q1W617 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
Shroom4Q1W617 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
Shroom4Q1W617 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Shroom4Q1W617 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Shroom4Q1W617 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Shroom4Q1W617 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Shroom4Q1W617 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Shroom4Q1W617 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Shroom4Q1W617 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Shroom4Q1W617 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Shroom4Q1W617 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Shroom4Q1W617 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Shroom4Q1W617 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Shroom4Q1W617 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Shroom4Q1W617 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Shroom4Q1W617 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Shroom4Q1W617 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Shroom4Q1W617 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Shroom4Q1W617 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Shroom4Q1W617 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
Shroom4Q1W617 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Shroom4Q1W617 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Shroom4Q1W617 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Shroom4Q1W617 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Shroom4Q1W617 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Shroom4Q1W617 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Shroom4Q1W617 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms