Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBK2

Krt80, Keratin, type II cytoskeletal 80, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt80Q0VBK2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt80Q0VBK2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt80Q0VBK2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt80Q0VBK2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt80Q0VBK2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt80Q0VBK2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt80Q0VBK2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt80Q0VBK2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt80Q0VBK2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt80Q0VBK2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt80Q0VBK2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt80Q0VBK2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt80Q0VBK2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt80Q0VBK2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt80Q0VBK2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt80Q0VBK2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt80Q0VBK2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt80Q0VBK2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt80Q0VBK2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt80Q0VBK2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt80Q0VBK2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt80Q0VBK2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt80Q0VBK2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt80Q0VBK2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt80Q0VBK2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt80Q0VBK2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt80Q0VBK2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt80Q0VBK2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt80Q0VBK2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt80Q0VBK2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt80Q0VBK2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt80Q0VBK2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt80Q0VBK2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt80Q0VBK2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt80Q0VBK2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt80Q0VBK2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt80Q0VBK2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt80Q0VBK2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt80Q0VBK2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt80Q0VBK2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt80Q0VBK2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt80Q0VBK2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt80Q0VBK2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt80Q0VBK2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt80Q0VBK2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt80Q0VBK2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt80Q0VBK2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt80Q0VBK2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt80Q0VBK2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt80Q0VBK2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt80Q0VBK2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt80Q0VBK2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt80Q0VBK2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt80Q0VBK2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt80Q0VBK2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt80Q0VBK2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt80Q0VBK2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt80Q0VBK2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt80Q0VBK2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt80Q0VBK2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt80Q0VBK2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt80Q0VBK2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt80Q0VBK2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt80Q0VBK2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt80Q0VBK2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt80Q0VBK2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt80Q0VBK2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt80Q0VBK2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt80Q0VBK2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt80Q0VBK2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt80Q0VBK2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt80Q0VBK2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt80Q0VBK2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt80Q0VBK2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt80Q0VBK2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt80Q0VBK2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt80Q0VBK2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt80Q0VBK2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt80Q0VBK2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt80Q0VBK2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt80Q0VBK2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt80Q0VBK2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt80Q0VBK2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt80Q0VBK2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt80Q0VBK2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt80Q0VBK2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt80Q0VBK2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt80Q0VBK2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt80Q0VBK2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt80Q0VBK2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt80Q0VBK2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt80Q0VBK2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt80Q0VBK2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt80Q0VBK2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt80Q0VBK2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt80Q0VBK2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt80Q0VBK2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt80Q0VBK2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms