Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb8Q0VBD0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itgb8Q0VBD0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Itgb8Q0VBD0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb8Q0VBD0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb8Q0VBD0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb8Q0VBD0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb8Q0VBD0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb8Q0VBD0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb8Q0VBD0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb8Q0VBD0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb8Q0VBD0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb8Q0VBD0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb8Q0VBD0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb8Q0VBD0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb8Q0VBD0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb8Q0VBD0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb8Q0VBD0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb8Q0VBD0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb8Q0VBD0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Itgb8Q0VBD0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itgb8Q0VBD0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb8Q0VBD0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb8Q0VBD0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb8Q0VBD0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb8Q0VBD0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb8Q0VBD0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb8Q0VBD0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb8Q0VBD0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb8Q0VBD0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb8Q0VBD0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb8Q0VBD0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb8Q0VBD0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb8Q0VBD0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb8Q0VBD0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb8Q0VBD0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb8Q0VBD0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb8Q0VBD0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb8Q0VBD0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms