Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
Lrriq1Q0P5X1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Lrriq1Q0P5X1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Lrriq1Q0P5X1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Lrriq1Q0P5X1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Lrriq1Q0P5X1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Lrriq1Q0P5X1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Lrriq1Q0P5X1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
Lrriq1Q0P5X1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Lrriq1Q0P5X1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Lrriq1Q0P5X1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Lrriq1Q0P5X1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Lrriq1Q0P5X1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Lrriq1Q0P5X1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Lrriq1Q0P5X1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
Lrriq1Q0P5X1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Lrriq1Q0P5X1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Lrriq1Q0P5X1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Lrriq1Q0P5X1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Lrriq1Q0P5X1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Lrriq1Q0P5X1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Lrriq1Q0P5X1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
Lrriq1Q0P5X1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Lrriq1Q0P5X1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
Lrriq1Q0P5X1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Lrriq1Q0P5X1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Lrriq1Q0P5X1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Lrriq1Q0P5X1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Lrriq1Q0P5X1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Lrriq1Q0P5X1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Lrriq1Q0P5X1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Lrriq1Q0P5X1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Lrriq1Q0P5X1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Lrriq1Q0P5X1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Lrriq1Q0P5X1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
Lrriq1Q0P5X1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC40.06■■■■■ 4
Lrriq1Q0P5X1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
Lrriq1Q0P5X1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Lrriq1Q0P5X1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Lrriq1Q0P5X1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Lrriq1Q0P5X1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Lrriq1Q0P5X1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Lrriq1Q0P5X1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
Lrriq1Q0P5X1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
Lrriq1Q0P5X1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Lrriq1Q0P5X1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Lrriq1Q0P5X1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Lrriq1Q0P5X1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Lrriq1Q0P5X1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Lrriq1Q0P5X1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Lrriq1Q0P5X1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Lrriq1Q0P5X1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Lrriq1Q0P5X1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC39.9■■■■□ 3.98
Lrriq1Q0P5X1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Lrriq1Q0P5X1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Lrriq1Q0P5X1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Lrriq1Q0P5X1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Lrriq1Q0P5X1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Lrriq1Q0P5X1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Lrriq1Q0P5X1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Lrriq1Q0P5X1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Lrriq1Q0P5X1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Lrriq1Q0P5X1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Lrriq1Q0P5X1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Lrriq1Q0P5X1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Lrriq1Q0P5X1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Lrriq1Q0P5X1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Lrriq1Q0P5X1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Lrriq1Q0P5X1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Lrriq1Q0P5X1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Lrriq1Q0P5X1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Lrriq1Q0P5X1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
Lrriq1Q0P5X1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Lrriq1Q0P5X1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Lrriq1Q0P5X1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Lrriq1Q0P5X1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
Lrriq1Q0P5X1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Lrriq1Q0P5X1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Lrriq1Q0P5X1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Lrriq1Q0P5X1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
Lrriq1Q0P5X1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Lrriq1Q0P5X1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Lrriq1Q0P5X1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Lrriq1Q0P5X1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Lrriq1Q0P5X1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Lrriq1Q0P5X1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Lrriq1Q0P5X1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Lrriq1Q0P5X1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
Lrriq1Q0P5X1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Lrriq1Q0P5X1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Lrriq1Q0P5X1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
Lrriq1Q0P5X1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Lrriq1Q0P5X1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Lrriq1Q0P5X1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Lrriq1Q0P5X1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.2 ms