Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Kndc1Q0KK55 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Kndc1Q0KK55 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Kndc1Q0KK55 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kndc1Q0KK55 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kndc1Q0KK55 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Kndc1Q0KK55 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kndc1Q0KK55 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kndc1Q0KK55 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kndc1Q0KK55 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Kndc1Q0KK55 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Kndc1Q0KK55 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Kndc1Q0KK55 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Kndc1Q0KK55 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Kndc1Q0KK55 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Kndc1Q0KK55 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Kndc1Q0KK55 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Kndc1Q0KK55 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kndc1Q0KK55 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Kndc1Q0KK55 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Kndc1Q0KK55 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Kndc1Q0KK55 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Kndc1Q0KK55 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Kndc1Q0KK55 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Kndc1Q0KK55 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Kndc1Q0KK55 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Kndc1Q0KK55 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Kndc1Q0KK55 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Kndc1Q0KK55 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Kndc1Q0KK55 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Kndc1Q0KK55 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Kndc1Q0KK55 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Kndc1Q0KK55 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Kndc1Q0KK55 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Kndc1Q0KK55 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kndc1Q0KK55 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kndc1Q0KK55 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Kndc1Q0KK55 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kndc1Q0KK55 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kndc1Q0KK55 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kndc1Q0KK55 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kndc1Q0KK55 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kndc1Q0KK55 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kndc1Q0KK55 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kndc1Q0KK55 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kndc1Q0KK55 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kndc1Q0KK55 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kndc1Q0KK55 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
Kndc1Q0KK55 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Kndc1Q0KK55 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kndc1Q0KK55 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kndc1Q0KK55 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Kndc1Q0KK55 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Kndc1Q0KK55 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Kndc1Q0KK55 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Kndc1Q0KK55 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Kndc1Q0KK55 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kndc1Q0KK55 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kndc1Q0KK55 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kndc1Q0KK55 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kndc1Q0KK55 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Kndc1Q0KK55 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kndc1Q0KK55 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Kndc1Q0KK55 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Kndc1Q0KK55 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kndc1Q0KK55 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kndc1Q0KK55 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kndc1Q0KK55 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kndc1Q0KK55 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kndc1Q0KK55 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kndc1Q0KK55 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Kndc1Q0KK55 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kndc1Q0KK55 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kndc1Q0KK55 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kndc1Q0KK55 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kndc1Q0KK55 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kndc1Q0KK55 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kndc1Q0KK55 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kndc1Q0KK55 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kndc1Q0KK55 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Kndc1Q0KK55 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kndc1Q0KK55 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Kndc1Q0KK55 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kndc1Q0KK55 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kndc1Q0KK55 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kndc1Q0KK55 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Kndc1Q0KK55 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Kndc1Q0KK55 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Kndc1Q0KK55 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Kndc1Q0KK55 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Kndc1Q0KK55 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Kndc1Q0KK55 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Kndc1Q0KK55 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Kndc1Q0KK55 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Kndc1Q0KK55 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Kndc1Q0KK55 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Kndc1Q0KK55 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Kndc1Q0KK55 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Kndc1Q0KK55 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
Kndc1Q0KK55 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms