Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Ttc21bQ0HA38 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Ttc21bQ0HA38 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Ttc21bQ0HA38 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ttc21bQ0HA38 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ttc21bQ0HA38 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Ttc21bQ0HA38 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ttc21bQ0HA38 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Ttc21bQ0HA38 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Ttc21bQ0HA38 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ttc21bQ0HA38 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ttc21bQ0HA38 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ttc21bQ0HA38 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Ttc21bQ0HA38 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ttc21bQ0HA38 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ttc21bQ0HA38 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ttc21bQ0HA38 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Ttc21bQ0HA38 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ttc21bQ0HA38 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Ttc21bQ0HA38 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ttc21bQ0HA38 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Ttc21bQ0HA38 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ttc21bQ0HA38 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Ttc21bQ0HA38 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ttc21bQ0HA38 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ttc21bQ0HA38 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ttc21bQ0HA38 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ttc21bQ0HA38 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Ttc21bQ0HA38 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Ttc21bQ0HA38 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ttc21bQ0HA38 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Ttc21bQ0HA38 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ttc21bQ0HA38 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ttc21bQ0HA38 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ttc21bQ0HA38 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ttc21bQ0HA38 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ttc21bQ0HA38 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Ttc21bQ0HA38 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ttc21bQ0HA38 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Ttc21bQ0HA38 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ttc21bQ0HA38 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ttc21bQ0HA38 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ttc21bQ0HA38 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ttc21bQ0HA38 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ttc21bQ0HA38 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ttc21bQ0HA38 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ttc21bQ0HA38 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ttc21bQ0HA38 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ttc21bQ0HA38 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ttc21bQ0HA38 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Ttc21bQ0HA38 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ttc21bQ0HA38 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ttc21bQ0HA38 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ttc21bQ0HA38 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ttc21bQ0HA38 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ttc21bQ0HA38 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ttc21bQ0HA38 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Ttc21bQ0HA38 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ttc21bQ0HA38 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ttc21bQ0HA38 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ttc21bQ0HA38 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ttc21bQ0HA38 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ttc21bQ0HA38 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ttc21bQ0HA38 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ttc21bQ0HA38 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ttc21bQ0HA38 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ttc21bQ0HA38 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ttc21bQ0HA38 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ttc21bQ0HA38 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ttc21bQ0HA38 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ttc21bQ0HA38 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ttc21bQ0HA38 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ttc21bQ0HA38 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ttc21bQ0HA38 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Ttc21bQ0HA38 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Ttc21bQ0HA38 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ttc21bQ0HA38 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ttc21bQ0HA38 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ttc21bQ0HA38 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ttc21bQ0HA38 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ttc21bQ0HA38 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ttc21bQ0HA38 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Ttc21bQ0HA38 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ttc21bQ0HA38 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ttc21bQ0HA38 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ttc21bQ0HA38 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
Ttc21bQ0HA38 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ttc21bQ0HA38 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Ttc21bQ0HA38 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ttc21bQ0HA38 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ttc21bQ0HA38 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ttc21bQ0HA38 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ttc21bQ0HA38 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ttc21bQ0HA38 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ttc21bQ0HA38 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ttc21bQ0HA38 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ttc21bQ0HA38 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Ttc21bQ0HA38 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ttc21bQ0HA38 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.1 ms