Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cntn3Q07409 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cntn3Q07409 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cntn3Q07409 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cntn3Q07409 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cntn3Q07409 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cntn3Q07409 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cntn3Q07409 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cntn3Q07409 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cntn3Q07409 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cntn3Q07409 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cntn3Q07409 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cntn3Q07409 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cntn3Q07409 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cntn3Q07409 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cntn3Q07409 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cntn3Q07409 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cntn3Q07409 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cntn3Q07409 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cntn3Q07409 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cntn3Q07409 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cntn3Q07409 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cntn3Q07409 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cntn3Q07409 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cntn3Q07409 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntn3Q07409 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntn3Q07409 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntn3Q07409 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntn3Q07409 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntn3Q07409 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cntn3Q07409 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cntn3Q07409 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cntn3Q07409 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cntn3Q07409 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cntn3Q07409 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cntn3Q07409 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cntn3Q07409 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cntn3Q07409 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cntn3Q07409 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cntn3Q07409 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cntn3Q07409 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cntn3Q07409 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cntn3Q07409 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cntn3Q07409 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cntn3Q07409 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cntn3Q07409 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cntn3Q07409 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cntn3Q07409 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntn3Q07409 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntn3Q07409 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntn3Q07409 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntn3Q07409 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntn3Q07409 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntn3Q07409 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntn3Q07409 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cntn3Q07409 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cntn3Q07409 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cntn3Q07409 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntn3Q07409 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntn3Q07409 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntn3Q07409 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntn3Q07409 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntn3Q07409 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntn3Q07409 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntn3Q07409 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntn3Q07409 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cntn3Q07409 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cntn3Q07409 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cntn3Q07409 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cntn3Q07409 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cntn3Q07409 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cntn3Q07409 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cntn3Q07409 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cntn3Q07409 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cntn3Q07409 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cntn3Q07409 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntn3Q07409 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntn3Q07409 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntn3Q07409 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cntn3Q07409 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cntn3Q07409 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cntn3Q07409 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cntn3Q07409 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cntn3Q07409 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cntn3Q07409 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cntn3Q07409 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntn3Q07409 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntn3Q07409 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntn3Q07409 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntn3Q07409 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cntn3Q07409 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cntn3Q07409 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cntn3Q07409 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cntn3Q07409 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cntn3Q07409 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cntn3Q07409 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntn3Q07409 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntn3Q07409 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntn3Q07409 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntn3Q07409 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms