Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mex3cQ05A36 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mex3cQ05A36 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mex3cQ05A36 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mex3cQ05A36 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mex3cQ05A36 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mex3cQ05A36 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mex3cQ05A36 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mex3cQ05A36 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Mex3cQ05A36 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mex3cQ05A36 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mex3cQ05A36 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mex3cQ05A36 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mex3cQ05A36 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Mex3cQ05A36 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mex3cQ05A36 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mex3cQ05A36 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Mex3cQ05A36 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mex3cQ05A36 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Mex3cQ05A36 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mex3cQ05A36 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Mex3cQ05A36 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mex3cQ05A36 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mex3cQ05A36 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mex3cQ05A36 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mex3cQ05A36 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mex3cQ05A36 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mex3cQ05A36 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mex3cQ05A36 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mex3cQ05A36 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mex3cQ05A36 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mex3cQ05A36 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mex3cQ05A36 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mex3cQ05A36 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Mex3cQ05A36 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mex3cQ05A36 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mex3cQ05A36 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mex3cQ05A36 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mex3cQ05A36 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mex3cQ05A36 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mex3cQ05A36 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Mex3cQ05A36 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mex3cQ05A36 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mex3cQ05A36 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mex3cQ05A36 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mex3cQ05A36 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mex3cQ05A36 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Mex3cQ05A36 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mex3cQ05A36 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mex3cQ05A36 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mex3cQ05A36 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mex3cQ05A36 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mex3cQ05A36 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mex3cQ05A36 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mex3cQ05A36 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mex3cQ05A36 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mex3cQ05A36 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mex3cQ05A36 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mex3cQ05A36 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mex3cQ05A36 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mex3cQ05A36 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mex3cQ05A36 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mex3cQ05A36 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mex3cQ05A36 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mex3cQ05A36 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mex3cQ05A36 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mex3cQ05A36 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mex3cQ05A36 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mex3cQ05A36 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mex3cQ05A36 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mex3cQ05A36 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mex3cQ05A36 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mex3cQ05A36 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Mex3cQ05A36 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mex3cQ05A36 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Mex3cQ05A36 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mex3cQ05A36 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Mex3cQ05A36 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mex3cQ05A36 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Mex3cQ05A36 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Mex3cQ05A36 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mex3cQ05A36 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mex3cQ05A36 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mex3cQ05A36 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mex3cQ05A36 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mex3cQ05A36 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mex3cQ05A36 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mex3cQ05A36 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mex3cQ05A36 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mex3cQ05A36 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mex3cQ05A36 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mex3cQ05A36 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mex3cQ05A36 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mex3cQ05A36 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mex3cQ05A36 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mex3cQ05A36 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mex3cQ05A36 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mex3cQ05A36 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mex3cQ05A36 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mex3cQ05A36 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms