Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CkbQ04447 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CkbQ04447 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CkbQ04447 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CkbQ04447 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CkbQ04447 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CkbQ04447 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CkbQ04447 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CkbQ04447 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CkbQ04447 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CkbQ04447 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CkbQ04447 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CkbQ04447 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CkbQ04447 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CkbQ04447 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CkbQ04447 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CkbQ04447 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CkbQ04447 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CkbQ04447 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CkbQ04447 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CkbQ04447 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CkbQ04447 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CkbQ04447 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CkbQ04447 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CkbQ04447 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CkbQ04447 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CkbQ04447 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CkbQ04447 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CkbQ04447 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CkbQ04447 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CkbQ04447 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CkbQ04447 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CkbQ04447 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CkbQ04447 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CkbQ04447 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CkbQ04447 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CkbQ04447 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CkbQ04447 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CkbQ04447 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CkbQ04447 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CkbQ04447 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CkbQ04447 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CkbQ04447 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CkbQ04447 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CkbQ04447 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CkbQ04447 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CkbQ04447 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CkbQ04447 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CkbQ04447 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CkbQ04447 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CkbQ04447 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CkbQ04447 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CkbQ04447 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CkbQ04447 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CkbQ04447 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CkbQ04447 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CkbQ04447 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CkbQ04447 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CkbQ04447 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CkbQ04447 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CkbQ04447 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CkbQ04447 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CkbQ04447 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CkbQ04447 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CkbQ04447 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CkbQ04447 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CkbQ04447 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CkbQ04447 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CkbQ04447 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CkbQ04447 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CkbQ04447 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CkbQ04447 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CkbQ04447 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CkbQ04447 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CkbQ04447 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CkbQ04447 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CkbQ04447 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CkbQ04447 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CkbQ04447 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CkbQ04447 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CkbQ04447 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CkbQ04447 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CkbQ04447 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CkbQ04447 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CkbQ04447 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CkbQ04447 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CkbQ04447 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CkbQ04447 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CkbQ04447 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CkbQ04447 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CkbQ04447 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CkbQ04447 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CkbQ04447 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CkbQ04447 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CkbQ04447 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CkbQ04447 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CkbQ04447 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CkbQ04447 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CkbQ04447 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CkbQ04447 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms