Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Thbs2Q03350 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Thbs2Q03350 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Thbs2Q03350 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Thbs2Q03350 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Thbs2Q03350 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Thbs2Q03350 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Thbs2Q03350 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Thbs2Q03350 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Thbs2Q03350 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Thbs2Q03350 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Thbs2Q03350 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Thbs2Q03350 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Thbs2Q03350 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Thbs2Q03350 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Thbs2Q03350 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Thbs2Q03350 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Thbs2Q03350 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Thbs2Q03350 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Thbs2Q03350 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Thbs2Q03350 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Thbs2Q03350 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Thbs2Q03350 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Thbs2Q03350 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Thbs2Q03350 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Thbs2Q03350 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Thbs2Q03350 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Thbs2Q03350 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Thbs2Q03350 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Thbs2Q03350 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Thbs2Q03350 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Thbs2Q03350 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Thbs2Q03350 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Thbs2Q03350 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Thbs2Q03350 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Thbs2Q03350 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Thbs2Q03350 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Thbs2Q03350 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Thbs2Q03350 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Thbs2Q03350 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Thbs2Q03350 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Thbs2Q03350 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Thbs2Q03350 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Thbs2Q03350 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Thbs2Q03350 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Thbs2Q03350 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Thbs2Q03350 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Thbs2Q03350 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Thbs2Q03350 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Thbs2Q03350 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Thbs2Q03350 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms