Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NfiaQ02780 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NfiaQ02780 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NfiaQ02780 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NfiaQ02780 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NfiaQ02780 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NfiaQ02780 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NfiaQ02780 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NfiaQ02780 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NfiaQ02780 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NfiaQ02780 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NfiaQ02780 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NfiaQ02780 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NfiaQ02780 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NfiaQ02780 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NfiaQ02780 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NfiaQ02780 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NfiaQ02780 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NfiaQ02780 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NfiaQ02780 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NfiaQ02780 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NfiaQ02780 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NfiaQ02780 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NfiaQ02780 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NfiaQ02780 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NfiaQ02780 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NfiaQ02780 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NfiaQ02780 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NfiaQ02780 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NfiaQ02780 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NfiaQ02780 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NfiaQ02780 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NfiaQ02780 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NfiaQ02780 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NfiaQ02780 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NfiaQ02780 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NfiaQ02780 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NfiaQ02780 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NfiaQ02780 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NfiaQ02780 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NfiaQ02780 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NfiaQ02780 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NfiaQ02780 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NfiaQ02780 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NfiaQ02780 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NfiaQ02780 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NfiaQ02780 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NfiaQ02780 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NfiaQ02780 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NfiaQ02780 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NfiaQ02780 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NfiaQ02780 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NfiaQ02780 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NfiaQ02780 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NfiaQ02780 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NfiaQ02780 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NfiaQ02780 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NfiaQ02780 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NfiaQ02780 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NfiaQ02780 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NfiaQ02780 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NfiaQ02780 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NfiaQ02780 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NfiaQ02780 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NfiaQ02780 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NfiaQ02780 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NfiaQ02780 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NfiaQ02780 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NfiaQ02780 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NfiaQ02780 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NfiaQ02780 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NfiaQ02780 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NfiaQ02780 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NfiaQ02780 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NfiaQ02780 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NfiaQ02780 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms