Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Htr1fQ02284 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Htr1fQ02284 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Htr1fQ02284 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Htr1fQ02284 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Htr1fQ02284 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Htr1fQ02284 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Htr1fQ02284 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Htr1fQ02284 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Htr1fQ02284 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Htr1fQ02284 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Htr1fQ02284 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Htr1fQ02284 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htr1fQ02284 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htr1fQ02284 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htr1fQ02284 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htr1fQ02284 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htr1fQ02284 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Htr1fQ02284 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Htr1fQ02284 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Htr1fQ02284 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Htr1fQ02284 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Htr1fQ02284 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Htr1fQ02284 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Htr1fQ02284 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Htr1fQ02284 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Htr1fQ02284 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Htr1fQ02284 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Htr1fQ02284 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Htr1fQ02284 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Htr1fQ02284 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Htr1fQ02284 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Htr1fQ02284 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Htr1fQ02284 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Htr1fQ02284 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Htr1fQ02284 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Htr1fQ02284 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Htr1fQ02284 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Htr1fQ02284 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Htr1fQ02284 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Htr1fQ02284 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Htr1fQ02284 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Htr1fQ02284 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Htr1fQ02284 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Htr1fQ02284 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Htr1fQ02284 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Htr1fQ02284 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Htr1fQ02284 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Htr1fQ02284 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Htr1fQ02284 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Htr1fQ02284 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htr1fQ02284 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Htr1fQ02284 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Htr1fQ02284 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Htr1fQ02284 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Htr1fQ02284 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Htr1fQ02284 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Htr1fQ02284 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Htr1fQ02284 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Htr1fQ02284 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms