Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RykQ01887 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RykQ01887 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RykQ01887 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RykQ01887 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RykQ01887 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RykQ01887 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RykQ01887 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RykQ01887 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RykQ01887 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RykQ01887 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RykQ01887 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RykQ01887 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RykQ01887 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RykQ01887 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RykQ01887 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RykQ01887 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RykQ01887 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RykQ01887 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RykQ01887 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RykQ01887 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RykQ01887 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RykQ01887 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RykQ01887 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RykQ01887 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RykQ01887 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RykQ01887 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RykQ01887 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RykQ01887 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RykQ01887 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RykQ01887 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RykQ01887 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RykQ01887 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RykQ01887 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RykQ01887 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RykQ01887 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RykQ01887 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RykQ01887 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RykQ01887 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RykQ01887 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RykQ01887 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RykQ01887 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RykQ01887 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RykQ01887 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RykQ01887 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RykQ01887 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RykQ01887 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RykQ01887 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RykQ01887 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RykQ01887 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RykQ01887 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RykQ01887 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RykQ01887 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RykQ01887 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RykQ01887 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RykQ01887 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RykQ01887 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RykQ01887 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RykQ01887 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RykQ01887 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RykQ01887 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RykQ01887 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RykQ01887 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RykQ01887 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RykQ01887 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RykQ01887 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RykQ01887 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RykQ01887 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RykQ01887 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RykQ01887 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RykQ01887 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RykQ01887 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RykQ01887 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RykQ01887 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RykQ01887 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RykQ01887 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RykQ01887 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RykQ01887 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RykQ01887 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RykQ01887 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RykQ01887 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RykQ01887 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RykQ01887 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RykQ01887 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RykQ01887 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RykQ01887 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RykQ01887 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RykQ01887 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RykQ01887 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RykQ01887 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RykQ01887 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RykQ01887 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RykQ01887 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RykQ01887 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RykQ01887 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RykQ01887 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RykQ01887 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RykQ01887 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RykQ01887 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RykQ01887 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms