Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nme2Q01768 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nme2Q01768 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nme2Q01768 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nme2Q01768 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nme2Q01768 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nme2Q01768 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nme2Q01768 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nme2Q01768 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nme2Q01768 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nme2Q01768 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nme2Q01768 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nme2Q01768 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nme2Q01768 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nme2Q01768 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nme2Q01768 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nme2Q01768 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme2Q01768 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme2Q01768 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme2Q01768 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme2Q01768 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nme2Q01768 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nme2Q01768 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nme2Q01768 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nme2Q01768 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nme2Q01768 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nme2Q01768 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nme2Q01768 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nme2Q01768 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nme2Q01768 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nme2Q01768 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nme2Q01768 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nme2Q01768 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nme2Q01768 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nme2Q01768 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nme2Q01768 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nme2Q01768 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme2Q01768 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme2Q01768 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme2Q01768 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme2Q01768 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme2Q01768 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme2Q01768 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme2Q01768 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme2Q01768 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme2Q01768 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme2Q01768 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nme2Q01768 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nme2Q01768 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nme2Q01768 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nme2Q01768 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nme2Q01768 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nme2Q01768 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nme2Q01768 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nme2Q01768 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nme2Q01768 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nme2Q01768 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nme2Q01768 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nme2Q01768 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nme2Q01768 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nme2Q01768 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nme2Q01768 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nme2Q01768 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nme2Q01768 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nme2Q01768 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nme2Q01768 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nme2Q01768 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nme2Q01768 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nme2Q01768 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nme2Q01768 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nme2Q01768 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nme2Q01768 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nme2Q01768 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nme2Q01768 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nme2Q01768 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nme2Q01768 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nme2Q01768 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nme2Q01768 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nme2Q01768 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nme2Q01768 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nme2Q01768 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nme2Q01768 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nme2Q01768 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nme2Q01768 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nme2Q01768 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nme2Q01768 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nme2Q01768 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nme2Q01768 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nme2Q01768 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nme2Q01768 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nme2Q01768 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nme2Q01768 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nme2Q01768 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nme2Q01768 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nme2Q01768 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nme2Q01768 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nme2Q01768 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nme2Q01768 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nme2Q01768 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nme2Q01768 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms