Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Col1a2Q01149 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Col1a2Q01149 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Col1a2Q01149 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Col1a2Q01149 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Col1a2Q01149 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Col1a2Q01149 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Col1a2Q01149 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Col1a2Q01149 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Col1a2Q01149 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Col1a2Q01149 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Col1a2Q01149 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Col1a2Q01149 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Col1a2Q01149 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Col1a2Q01149 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Col1a2Q01149 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Col1a2Q01149 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Col1a2Q01149 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Col1a2Q01149 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Col1a2Q01149 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Col1a2Q01149 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Col1a2Q01149 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Col1a2Q01149 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Col1a2Q01149 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Col1a2Q01149 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Col1a2Q01149 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Col1a2Q01149 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Col1a2Q01149 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Col1a2Q01149 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Col1a2Q01149 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Col1a2Q01149 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Col1a2Q01149 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Col1a2Q01149 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Col1a2Q01149 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Col1a2Q01149 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Col1a2Q01149 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Col1a2Q01149 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Col1a2Q01149 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Col1a2Q01149 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Col1a2Q01149 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Col1a2Q01149 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Col1a2Q01149 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Col1a2Q01149 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Col1a2Q01149 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Col1a2Q01149 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Col1a2Q01149 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Col1a2Q01149 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Col1a2Q01149 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Col1a2Q01149 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Col1a2Q01149 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Col1a2Q01149 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Col1a2Q01149 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Col1a2Q01149 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Col1a2Q01149 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Col1a2Q01149 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Col1a2Q01149 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Col1a2Q01149 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Col1a2Q01149 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Col1a2Q01149 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Col1a2Q01149 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Col1a2Q01149 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Col1a2Q01149 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Col1a2Q01149 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Col1a2Q01149 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Col1a2Q01149 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Col1a2Q01149 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Col1a2Q01149 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Col1a2Q01149 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Col1a2Q01149 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Col1a2Q01149 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Col1a2Q01149 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Col1a2Q01149 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Col1a2Q01149 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Col1a2Q01149 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Col1a2Q01149 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Col1a2Q01149 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Col1a2Q01149 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Col1a2Q01149 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Col1a2Q01149 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Col1a2Q01149 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Col1a2Q01149 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Col1a2Q01149 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Col1a2Q01149 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Col1a2Q01149 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Col1a2Q01149 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Col1a2Q01149 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Col1a2Q01149 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Col1a2Q01149 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Col1a2Q01149 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Col1a2Q01149 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Col1a2Q01149 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Col1a2Q01149 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Col1a2Q01149 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Col1a2Q01149 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Col1a2Q01149 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Col1a2Q01149 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col1a2Q01149 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col1a2Q01149 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Col1a2Q01149 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Col1a2Q01149 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms