Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
SelpQ01102 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
SelpQ01102 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
SelpQ01102 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
SelpQ01102 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27,19■■□□□ 1,94
SelpQ01102 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
SelpQ01102 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27,19■■□□□ 1,94
SelpQ01102 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
SelpQ01102 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
SelpQ01102 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
SelpQ01102 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
SelpQ01102 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
SelpQ01102 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
SelpQ01102 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27,16■■□□□ 1,94
SelpQ01102 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
SelpQ01102 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
SelpQ01102 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
SelpQ01102 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27,12■■□□□ 1,93
SelpQ01102 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
SelpQ01102 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
SelpQ01102 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,1■■□□□ 1,93
SelpQ01102 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
SelpQ01102 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
SelpQ01102 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
SelpQ01102 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
SelpQ01102 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
SelpQ01102 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
SelpQ01102 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
SelpQ01102 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
SelpQ01102 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
SelpQ01102 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
SelpQ01102 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
SelpQ01102 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
SelpQ01102 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
SelpQ01102 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
SelpQ01102 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27,05■■□□□ 1,92
SelpQ01102 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
SelpQ01102 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27,04■■□□□ 1,92
SelpQ01102 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
SelpQ01102 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
SelpQ01102 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
SelpQ01102 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
SelpQ01102 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27,03■■□□□ 1,92
SelpQ01102 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
SelpQ01102 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
SelpQ01102 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27,02■■□□□ 1,92
SelpQ01102 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
SelpQ01102 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,01■■□□□ 1,91
SelpQ01102 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
SelpQ01102 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26,98■■□□□ 1,91
SelpQ01102 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
SelpQ01102 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
SelpQ01102 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
SelpQ01102 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
SelpQ01102 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
SelpQ01102 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
SelpQ01102 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26,96■■□□□ 1,91
SelpQ01102 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
SelpQ01102 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
SelpQ01102 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
SelpQ01102 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26,94■■□□□ 1,9
SelpQ01102 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
SelpQ01102 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
SelpQ01102 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
SelpQ01102 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
SelpQ01102 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
SelpQ01102 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
SelpQ01102 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
SelpQ01102 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
SelpQ01102 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
SelpQ01102 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
SelpQ01102 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
SelpQ01102 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
SelpQ01102 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
SelpQ01102 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26,91■■□□□ 1,9
SelpQ01102 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
SelpQ01102 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
SelpQ01102 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
SelpQ01102 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
SelpQ01102 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
SelpQ01102 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26,88■■□□□ 1,89
SelpQ01102 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26,87■■□□□ 1,89
SelpQ01102 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26,87■■□□□ 1,89
SelpQ01102 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
SelpQ01102 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26,87■■□□□ 1,89
SelpQ01102 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
SelpQ01102 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
SelpQ01102 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
SelpQ01102 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
SelpQ01102 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
SelpQ01102 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
SelpQ01102 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
SelpQ01102 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
SelpQ01102 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
SelpQ01102 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
SelpQ01102 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
SelpQ01102 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
SelpQ01102 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
SelpQ01102 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26,81■■□□□ 1,88
SelpQ01102 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,7 ms