Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SeleQ00690 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SeleQ00690 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SeleQ00690 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SeleQ00690 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SeleQ00690 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SeleQ00690 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SeleQ00690 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SeleQ00690 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SeleQ00690 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SeleQ00690 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SeleQ00690 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SeleQ00690 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SeleQ00690 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SeleQ00690 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SeleQ00690 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SeleQ00690 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SeleQ00690 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SeleQ00690 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SeleQ00690 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SeleQ00690 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SeleQ00690 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SeleQ00690 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SeleQ00690 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SeleQ00690 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SeleQ00690 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SeleQ00690 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SeleQ00690 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SeleQ00690 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SeleQ00690 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SeleQ00690 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SeleQ00690 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SeleQ00690 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SeleQ00690 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SeleQ00690 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SeleQ00690 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SeleQ00690 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SeleQ00690 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SeleQ00690 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SeleQ00690 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SeleQ00690 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SeleQ00690 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SeleQ00690 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SeleQ00690 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SeleQ00690 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SeleQ00690 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SeleQ00690 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SeleQ00690 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SeleQ00690 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SeleQ00690 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SeleQ00690 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SeleQ00690 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SeleQ00690 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SeleQ00690 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SeleQ00690 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SeleQ00690 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SeleQ00690 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SeleQ00690 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SeleQ00690 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SeleQ00690 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SeleQ00690 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SeleQ00690 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SeleQ00690 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SeleQ00690 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SeleQ00690 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SeleQ00690 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SeleQ00690 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SeleQ00690 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SeleQ00690 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SeleQ00690 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SeleQ00690 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SeleQ00690 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SeleQ00690 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SeleQ00690 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SeleQ00690 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SeleQ00690 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SeleQ00690 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SeleQ00690 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SeleQ00690 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SeleQ00690 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SeleQ00690 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SeleQ00690 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SeleQ00690 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SeleQ00690 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SeleQ00690 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SeleQ00690 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SeleQ00690 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SeleQ00690 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SeleQ00690 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SeleQ00690 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SeleQ00690 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SeleQ00690 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SeleQ00690 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SeleQ00690 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SeleQ00690 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SeleQ00690 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SeleQ00690 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SeleQ00690 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SeleQ00690 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SeleQ00690 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.9 ms