Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr2cP97760 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr2cP97760 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr2cP97760 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr2cP97760 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2cP97760 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2cP97760 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2cP97760 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2cP97760 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr2cP97760 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Polr2cP97760 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2cP97760 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2cP97760 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2cP97760 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2cP97760 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2cP97760 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2cP97760 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2cP97760 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2cP97760 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2cP97760 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2cP97760 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2cP97760 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2cP97760 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2cP97760 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2cP97760 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2cP97760 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2cP97760 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2cP97760 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2cP97760 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2cP97760 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2cP97760 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2cP97760 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2cP97760 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2cP97760 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2cP97760 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2cP97760 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2cP97760 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2cP97760 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2cP97760 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2cP97760 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr2cP97760 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr2cP97760 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2cP97760 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2cP97760 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2cP97760 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2cP97760 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2cP97760 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2cP97760 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2cP97760 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2cP97760 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2cP97760 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2cP97760 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2cP97760 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2cP97760 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2cP97760 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2cP97760 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2cP97760 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2cP97760 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2cP97760 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2cP97760 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2cP97760 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2cP97760 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2cP97760 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2cP97760 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2cP97760 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2cP97760 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2cP97760 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2cP97760 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2cP97760 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2cP97760 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr2cP97760 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr2cP97760 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2cP97760 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2cP97760 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2cP97760 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr2cP97760 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr2cP97760 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr2cP97760 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2cP97760 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2cP97760 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2cP97760 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2cP97760 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2cP97760 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2cP97760 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2cP97760 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2cP97760 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2cP97760 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2cP97760 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2cP97760 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2cP97760 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2cP97760 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2cP97760 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2cP97760 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2cP97760 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2cP97760 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2cP97760 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2cP97760 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2cP97760 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2cP97760 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2cP97760 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms